宏基因组拼接方法
最新推荐文章于 2023-03-02 15:23:00 发布
宏基因组拼接主要采用de Bruijn算法,该方法速度快、准确度高,适用于NGS测序。通过构建k-mer重叠图,解决序列拼接问题。工具如Velvet、SPAdes、IDBA-UD等运用此算法。测序深度和覆盖度是关键,30X的测序深度可形成基因草图。scaffold组装结合序列比对和paired read信息来填补缺口。
摘要由CSDN通过智能技术生成