Rosetta是什么?

Rosetta是一套用于模拟大分子结构的综合软件。最早与1998年用FORTRAN编写,用于对小蛋白进行 ab initio 预测。现在已经用C++重写,作为一种灵活、多用途的应用,它包括蛋白质和核酸的结构预测、设计和重塑工具。PyRosettaFoldItRosettaScriptsROSIE 等是基于Rosetta3实现的。

Rosetta的web服务器已经运行了数十亿的结构预测和蛋白质设计模拟,还有数十亿甚至数万亿运行在超级计算机集群上。

研究人员利用Rosetta来更好地了解传染病、癌症和自身免疫性疾病的治疗方法。进一步的应用包括开发疫苗、新材料、靶向蛋白粘合剂和酶设计。

Rosetta最初是一个结构预测工具,在 CASP 社区范围内的盲预测训练中一直表现出色。它已经成长为提供多种有效的采样算法来探索主链、侧链和序列空间,其优点已经推广到包括 RNA-puzzles 和 CAPRI 在内的更多社区范围的练习中。罗塞塔拥有广泛测试的能量评分功能,包含从折叠到对接到设计的无与伦比的应用范围。

Rosetta 可以免费提供给学术和政府实验室,已经有超过10000个免费许可证在使用。还包括一个活跃的论坛。要下载Rosetta,请申请许可证

如果你已经准备好给试一试Rosetta,建议从这里开始尝试这些教程

👸号:咚咚科研

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