解惑 | 逆转录时到底要不要去除gDNA?

在逆转录过程中去除gDNA是为了避免cDNA定量结果受污染影响,提高实验可信度。gDNA可通过DNase I处理在逆转录前去除,一步法操作更为简便。此外,RNA提取时的gDNA去除、引物设计跨越内含子也是减少gDNA干扰的有效方法。ABclonal提供带gDNA去除功能的逆转录预混液,助力科研工作。
摘要由CSDN通过智能技术生成

导读

现在很多逆转录产品都带有去gDNA功能,那么在逆转录时为什么要去除gDNA呢?逆转录产品去除gDNA的原理是什么呢?如果逆转录时不去除gDNA会有什么样的后果呢?本文将会详细的为大家解答这个问题。


基因在不同组织、发育阶段、处理条件下的差异表达,可能会反映基因的功能以及被调控的机制,因此基因表达定量研究是生物学研究中最基础的内容之一。常用的基因表达量研究方法是RT+qPCR,即先将RNA逆转录成cDNA,再用qPCR对cDNA进行定量,特定基因cDNA的丰度能够反映出其mRNA的丰度,也就是基因的转录表达水平。


为什么要在逆转录时去除gDNA?

很多时候,我们提取到的RNA可能会混有gDNA(基因组DNA),而用这种有gDNA污染的RNA模板逆转录时,cDNA产物中也会混有gDNA。cDNA和gDNA在qPCR反应中可能会被同时扩增,我们无法区分荧光信号是来自于cDNA还是gDNA,因此cDNA的定量结果可能会存在偏差。特别是低表达量的基因,本身的扩增信号低,Ct值大,更加容易受到gDNA污染的影响。因此,如果能够在逆转录的时候,加一步gDNA去除的步骤,能够有效的降低gDNA污染的影响,增加实验的可信度。


逆转录产品去除gDNA的原理

gD

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