不同类型的基因组变异示意图(图片来源:labspaces)
上次给大家总结介绍了基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的鉴定方法,今天给大家介绍结构变异(structural variations,SV)的种类及基于基因组测序数据的鉴定方法。
因为结构变异是造成物种表型差异的一个重要原因,且与各类疾病,特别是癌症的发生、发展紧密相关,因此研究结构变异非常重要。
结构变异通常是指长度大于1Kb的基因组序列变异,包括多种不同的类型:插入(insertion)、缺失(deletion)、反转(inversion)、异位(translocation)、拷贝数变异(copy number variation,CNV或者duplication)(更多精彩请关注微信公众号:AIPuFuBio)。
具体如下示意图所示:
不同类型结构变异的示意图(图片来源:Alkan et al.,