在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用。其中转录组测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录本的表达情况。但传统的转录组测序技术(bulk RNA-seq)是基于群体细胞,每个样本包含成千上万个细胞,所以最终反映的是基因在群体细胞中平均表达水平,从而掩盖了不同细胞之间的表达异质性。近年来,**单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性**。目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)的不同类型组织和细胞系,包括正常和病变细胞等。自从2009年等由汤富酬等人开发出了第一种单细胞转录组测序技术,目前已经有几十种不同的单细胞转录组测序技术相继被开发出来,它们都有各自的特点,拥有特定的优势和缺点。为了正确利用相应的单细胞测序技术开展相关研究和应用,非常有必要充分了解这些不同技术的优缺点。
图1、单细胞转录组测序技术的发展史(Svensson et al. NATURE PROTOC