在开展二代测序相关课题研究时,经常需要上传或者下载SRA数据库中的数据,对熟悉Linux系统、懂代码的同学们来说是非常容易的事情。但像小编这一类看到代码两眼一抹黑的小白就有点难度了,尤其电脑还是Windows系统。那是不是我就无能为力了?经过不断地查阅和尝试,还真找到一套Windows系统下进行数据下载的方法,这里赶紧迫不及待地分享给大家。
第一种情况,单一样本的数据下载。这是一个比较容易的过程,我们要下载数据就需要先找到数据,并找到自己所需要的合适格式的数据,然后进行下载即可。下面的流程是小编操作一步写一步整理出来的,因为比较简单,所以不会踩坑,照着操作就可以。
1、搜索NCBI数据库中的SRA数据库
2、以数据SRX3093954为例做介绍
把这个数据填到上面链接的搜索框中,如下图所示。
3、点击search就可以得到下图
4、点击下图红圈中的超链接
5、得到下面的截图
6、然后点击FASTA/FASTQ download这个按钮
就得到下面的截图,再点击右下角红圈中的选一种格式下载就可以。