分享 | 一文带您全面了解FFPE样本

在组学研究中，如蛋白组学、代谢组学等，血液是常见的样本类型。然而，在这种常见样本类型的背后还存在一类更丰富的样本资源---FFPE（formalin fixation and paraffin embedding）样本，中文是指福尔马林固定石蜡包埋的组织样本。FFPE样本可当之无愧地称为病理科的“瑰宝”，因为它们承载着众多疾病相关信息；FFPE也是目前长期保存病理样本的金标准，在过去的几十年中，按照该方法，全世界已经存档了大量生物样品[1]。

然而，在过去，由于技术受限使FFPE样本无法最大程度发挥自身的价值，从而成为了尘封的“宝藏”。近年来，随着各种技术的发展以及研究的进步，FFPE样本的应用也逐渐多样化。从最开始应用于免疫组化进行疾病诊断和病理分型，到目前应用到各种组学研究中，FFPE样本即将迎来自身的“高光”时代。下面小编就带着大家一起梳理一下FFPE样本的相关知识。

1    FFPE样本出现的原因

为保护细胞结构的完整性，先使用福尔马林固定组织样本，然后使用石蜡包埋，以方便切成薄片的组织样本就是FFPE样本。之所以会出现FFPE样本，主要是因为可以在常温下较长时间地保存组织或制备检验所需的组织标本。

2  FFPE样本的制备步骤

其制备过程分为5个步骤，大致过程是将组织内的物质相互交联固定，并去掉组织中的水分，使用石蜡包埋以方便切片。具体步骤及每一个步骤的目的参见下图：

图1 FFPE样本制备步骤及目的

制备完成并进行切片后如下图所示，平时我们所说的送样时送10片左右即可，就是下面这种FFPE切片样本。