【PaperReading】Spherical Message Passing for 3D Molecular Graphs

本文提出了一种新的三维分子图表示学习方法——球形消息传递(SMP),用于捕捉分子的完整三维信息。SMP在球坐标系中进行消息传递,降低了计算复杂性,适用于大规模分子。作者还介绍了基于SMP的SphereNet,它利用有意义的三维物理信息,提高了预测任务的性能。实验表明,SphereNet在效率和准确性上表现优秀。

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三维分子图的球形消息传递

Spherical Message Passing for 3D Molecular Graphs
论文地址:https://arxiv.org/abs/2102.05013
论文作者:Yi Liu, Limei Wang, Meng Liu, Yuchao Lin, Xuan Zhang, Bora Oztekin & Shuiwang Ji
发表期刊:ICLR 2022 Poster
论文代码:https://github.com/divelab/DIG

摘要

作者在此工作中考虑了三维分子图的表示学习,其中每个原子与三维的空间位置相关联。这是一个尚未得到充分探索的研究领域,目前还缺乏一个有效的信息传递框架。在这项工作中,作者在球坐标系(spherical coordinate system, SCS)中进行了分析,以完整地识别三维图结构

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