DAP-seq已经做过的物种有哪些(DAP-seq技术服务已做物种),已发表多篇高影响因子文章,无需制备抗体和构建转基因材料,为非模式植物的转录调控研究提供了新方法

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DAP-seq已经做过的物种都有什么

蓝景科信DAP-seq已做物种:

拟南芥,烟草,水稻,小麦,藜麦,玉米,大豆,棉花,苜蓿,高粱,大麦草,百脉根,油菜,白菜,黄瓜,菜心,番茄,荔枝,香蕉,葡萄,苹果,柑橘,甜橙,桃,甜瓜,甘蔗,樱桃,草莓,杜梨,芍药,枣,核桃,毛果杨,胡杨,油松,毛白杨,山新杨,欧美杨,大青杨,84K杨,白桦,光皮桦,欧洲云杉,刚毛怪柳,麻疯树,金银花,丹参,木薯,地钱,腐霉,苔藓,糙皮侧耳,猪苓真菌,飞蝗,肺炎克雷伯菌,布鲁氏菌等80多个物种。

DAP-seq对于模式物种和非模式物种均适用,不用再发愁与转基因材料的构建,抗体的制备,为非模式物种的转录调控研究提供了新思路,新方法。

一般来说,有参考基因组的物种就可以进行DAP-seq实验,没有参考基因组,也可以考虑使用近缘物种的参考基因组来分析。

蓝景科信河北生物科技有限公司的客户发表文章(1-5-6-3-2-2-4-9-7-9-8):
2022年8月,广西大学农学院甘蔗生物学重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室张木清/姚伟研究团队在**Journal of Experimental Botany(IF=7.298)**在线发表了题为“ScAIL1 modulates plant defense responses by targeting DELLA and regulating GA and JA signaling”的研究论文,该研究发现了一个甘蔗新的AP2家族转录因子ScAIL1,通过靶向DELLA调节JA与GA合成,平衡植物生长与防御。

2022年8月,安徽农业大学、中国水稻研究所和上海市农业科学院作物育种栽培研究所在**The Plant Journal(IF=5.726)**期刊联合发表了题为“OsSGT1 promotes melatonin-ameliorated seed tolerance to chromium stress by affecting the OsABI5-OsAPX1 transcriptional module in rice”的文章,揭示了OsSGT1和ABI5相互作用,调控OsAPX1的表达,促进褪黑素改善种子在铬污染条件下萌发的分子机制。

2022年8月,扬州大学生物科学与技术学院、植物功能基因组学教育部重点实验室高勇课题组在**The Plant Cell(IF=12.085)**上在线发表了题为“Phytochrome Interacting Factor Regulates Stomatal Aperture by Coordinating Red Light and Abscisic Acid”的研究论文,揭示了光敏色素互作因子(phytochrome interacting factors, PIFs)通过协调红光和脱落酸(ABA)信号调节气孔开度的分子机制。

2022年7月,北京市农林科学院玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室、齐鲁师范大学玉米分子育种研究院的共同研究成果,在国际知名学术期刊**Theoretical and Applied Genetics(IF=5.574)**上发表,题目为“ A newly characterized allele of ZmR1 increases anthocyanin content in whole maize plant and the regulation mechanism of diferent ZmR1 alleles”。本文主要研究内容是鉴定了玉米花青素合成相关等位基因ZmR1CQ01,并揭示了3个ZmR1等位基因的生物学功能和分子调控机制。

2022年5月,中科院植物所王雷研究组在**Plant Physiology(IF=8.005)**期刊上发表了题为“Rice CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED1 transcriptionally regulates ABA signaling to confer multiple abiotic stress tolerance”的研究成果。该研究揭示了OsCCA1调控水稻适应盐胁迫、干旱胁迫以及渗透胁迫的分子机制。其中,该研究使用了DNA亲和纯化测序技术(DAP-seq,DNA Affinity Purification Sequencing),鉴定了水稻生物钟核心组分OsCCA1(Oryza sativa CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED 1)调控的下游靶基因。

2020年4月,北京工商大学与蓝景科信合作,**Biochemical and Biophysical Research Communications(IF=3.322)**发表了题为“ Phytochrome-interacting factors regulate seedling growth through ABA signaling”的文章,为揭示PIFs转录因子调控ABA信号转导机制提供了重要线索。

2019年9月,北京林业大学和蓝景科信合作,在植物学主流学术期刊**Journal of Experimental Botany(IF=5.36)**上,发表了题为“Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H±ATPase gene to enhance gene expression and salt tolerance”的研究成果。该研究借助DNA亲和纯化测序(DNA Affinity Purification Sequencing,DAP-seq)技术,深入揭示了胡杨耐盐的分子机制。

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