多聚核糖体分析(Polysome Profiling)

技术简介

基因表达在多个层面上受到调控,包括:表观遗传水平调控、转录水平调控、翻译水平调控以及翻译后修饰调控。其中,翻译调控控制着蛋白质的生物合成以响应生理和病理的变化。而且,翻译水平的调控也深刻影响了蛋白质的丰度。研究翻译水平的调控机制,有助于深入理解基因表达调控机制,并且可以解释转录组和蛋白质组分析之间的差异。

多聚核糖体分析(Polysome profiling)是研究翻译调控机制常用的技术。Polysome profiling通过蔗糖密度梯度超速离心分离free mRNA、40S和60S核糖体亚基、单核糖体和多聚核糖体,收集含有多聚核糖体的部分用于RNA或蛋白质分析。也可以通过酶消化检测disome。

Polysome profiling既可用于特定mRNA的靶向分析,也可用于整体分析。相对于Ribo-seq来说还可以获得全长翻译的mRNA,包括非翻译区(UTRs),而UTRs含有调节选择性翻译的顺式作用元件。鉴定与翻译的mRNA亚型相对应的UTRs和保守的顺式作用元件对于基因表达调控的机制分析至关重要。此外,多聚体分析可以与免疫印迹或蛋白质组学相结合,来监测与核糖体或起始复合物相关的蛋白质。最后,多聚体图谱分析特别适用于缺少基因组数据或不可能进行基因操作的模式生物。

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