介绍
STAMP图(STAMP plot)并非一个广泛认知的、具有特定名称的图表类型,而是可能指在STAMP(Statistical Analysis of Metagenomic Profiles:“STAMP: statistical analysis of taxonomic and functional profiles”)软件使用过程中生成的各种统计和可视化图表的总称。STAMP是一款用于分析宏基因组(metagenomic)数据(如物种注释和功能注释)的软件包,它支持统计假设检验、提供多种探索性图表,并鼓励使用效应大小和置信区间来评估生物学重要性。通常我们会在两组比较采用下图方式(现在我们使用ggplot2实现该软件的这项功能):
该STAMP图可以提供以下信息:
- 效