在线作图丨差异分析——在线做Stamp分析

最新推荐文章于 2023-02-10 11:25:07 发布
VIP文章 最新推荐文章于 2023-02-10 11:25:07 发布
阅读量3.3k 收藏 13
点赞数 3
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weifanbio/article/details/118784594
版权

Q1：什么是RDA分析？
Stamp软件是一款用于组间差异分析的软件，适用于多种类型的组间差异分析，比如物种分布及丰度差异、基因差异、功能差异等等。该软件2014年发表于Bioinformatics，几乎适用于所有的组间差异分析，目前已被引用数百次。TUTU网站提供Stamp分析工具的在线分析功能，无需安装软件即可实现组间差异可视化。示例：The two runs showed similar trends, with CNSL feeding increasing the lipid, carbohydrate and vitamin metabolisms. However, these differences became significant (P < 0.01) only in Run 2 at the higher CNSL dose (Fig).参考文献：Network analysis and functional estimation of the microbiome reveal the effects of cashew nut shell liquid feeding on methanogen behaviour in the rumen。
在这里插入图片描述

Q2：如何不使用R语言进行Stamp分析？
小编和他的小伙伴们开发了一个在线的作图小网站——云图图（www.cloudtutu.com࿰

最低0.47元/天 解锁文章
作图帮
关注
  • 3
    点赞
  • 踩
  • 13
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 2
    评论
R可视化：组间差异的STAMP图的ggplot2实现
H20230717的博客
07-19 260
组间差异的STAMP图在R中的实现
基于STAMP模型对某金矿爆炸事故致因分析-论文
07-08
为探究某金矿爆炸事故发生的原因，从系统论的角度，利用STAMP模型建立3个基本层次控制结构，对事故所涉及系统的安全约束、分层安全控制结构、物理过程、基层操作、外部监管、动态过程视角进行综合分析，发现工人的...
R语言STAMP-丰度差异比较图
whiteof的博客
02-10 1231
R语言实现STAMP软件差异比较图
群落组间差异分析
u010009053的博客
08-13 3681
1. Biomarker 根据丰度信息，找出不同组分之间的差异因素（物种、功能），继而确定其生物学的相关性。 2.专业分析软件 Metastats LEfSe STAMP Metastats 应用范围： 只能两组样本之间比较（非参数T检验（参数T检验，一般用于正态分布），卡方检验） 分析上可以没有生物学重复 作用： 差异物种分析 差异功能分析 特点： 只能做两组之间的对比（在利用one wa...
stamp做图软件
09-11
stamp是一款应用在高通量测序中的，差异物种分析和做图软件
主成分分析（PCA）法
09-05
三个文件。1、princomp()函数 2、封装一下princomp()函数 3、pca()函数
oracle 数据类型详解---日期型
MKing's Blog
05-13 1万+
oracle 数据类型详解---日期型      oracle数据类型看起来非常简单，但用起来会发现有许多知识点，本文是我对ORACLE日期数据类型的一些整理，都是开发入门资料，与大家分享：注：由于INTERVAL及TIME ZONE实际用得比较少，所以本文内容未涉及这两个方面。1、常用日期型数据类型1.1、DATE这是ORACLE最常用的日期类型，它可以保存日期和时间，常用日期处理都
R语言重现STAMP结果图
Christina
07-23 2725
来源：公众号红皇后学术 我们通常使用的STAMP的结果主要就是两组数据之间差异性检验的被称作Extended error bar(扩展柱状图)的图像。 由于STAMP的结果图相对固定，可修改的图像参数有限，经常会遇到一些问题，比如靶标物种或功能基因名字过程就会导致显示不全，在与其它图像拼接成一副图的时候也会出现字号太小导致看不清楚的问题。 数据准备 这里我将使用一套同一环境位点水体和沉积物16S扩增子测序的PICRUSt功能预测结果作为示例。 选择的是KEGG L2水平的功能预测的相对丰度数据。
243.STAMP图形界面微生物组分析软件
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
09-14 1万+
243.图形界面微生物组分析软件STAMP：使用说明与实例展示本节作者：赵丹阳，中国药科大学版本1.0.4，更新日期：2020年9月7日本项目永久地址：https://github.co...
STAMP：扩增子、宏基因组统计分析神器(中文帮助文档)
热门推荐
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
05-25 2万+
简介 软件简介 STAMP能干什么 分析实战 输入文件 多组比较——肠型 属性面板功能简介 图表类型介绍 统计表导出 其它功能 统计方法 关于样本重复 多组比较 分析两组 分析两样品 常见问题 读入文件错误 实验设计和丰度矩阵样品名不对应 总结 Reference 猜你喜欢 写在后面 之前本平台分享过STAMP的使用： - 微生物组间差异分析神器-STAMP ...
微生物多样性组间差异分析神器-STAMP
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
09-18 1万+
微生物多样性组间差异分析神器-STAMP
STAMP_2_1_3.exe
05-09
主要用于微生物数据群落组成，代谢，蛋白组的数据分析
shuiyin.rar_stamp
09-24
水印的制作:所谓“水印”,即是一种记号,就像盖章一样。最大的作用就是不让别人使用这张图片(即防止盗版)。
Elasticsearch初识与简单案例.pdf
04-29
Elasticsearch是一个基于Lucene的分布式全文搜索引擎，提供灵活且高效的搜索和分析功能。通过HTTP请求和客户端库，用户可以索引和搜索文档，执行复杂查询，进行数据分析，并享受高亮显示等特性。其高级功能如复合查询、聚合分析、滚动搜索等，使其适用于各种数据处理和分析场景。Elasticsearch还具有强大的监控和日志功能，确保集群稳定运行。总之，Elasticsearch是企业级搜索和分析的理想选择。
Python基于LSTM模型对全国的空气质量数据进行可视化分析预测源代码
最新发布
04-29
介绍 对全国2019年1月至2023年12月的空气质量数据进行分析，绘制时间序列图，展示每月/每季度的平均AQI变化趋势。绘制不同省份和城市的平均AQI热力图。分析不同污染物的浓度分布和趋势。绘制空气质量等级分布图。 需求说明 对空气质量数据进行数据分析，并使用LSTM模型进行预测。 安装教程 pip install jupyter pip install numpy pandas matplotlib seaborn 使用说明 在项目路径下打开终端输入jupyter notebook就行
百问网linux桌面GUI，基于LVGL 8.x。.zip
04-29
百问网linux桌面GUI，基于LVGL 8.x。
基于Vue开发的XMall商城前台页面 PC端.zip
04-29
基于Vue开发的XMall商城前台页面 PC端.zip
2019年中国民航大学电子设计竞赛E题-自动导航运输车
04-29
2019年中国民航大学电子设计竞赛E题-自动导航运输车 全国大学生电子设计竞赛（National Undergraduate Electronics Design Contest），试题，解决方案及源码。计划或参加电赛的同学可以用来学习提升和参考
精灵宝可梦go游戏UI界面设计PSD源文件.zip
04-29
游戏开发资源，游戏UI，游戏GUI，游戏图标，PSD格式，XD格式，PNG下载，源文件，可编辑下载，游戏购物充值界面，宝石，图标，PS格式，AI格式等，游戏APP
python turtle stamp
09-09
### 回答1： Sure, I can help you with that! The `stamp()` method in the Python `turtle` module is used to stamp a copy of the turtle shape onto the turtle's current position on the screen. Here's an example code snippet that demonstrates how to use the `stamp()` method: ```python import turtle # create a turtle object t = turtle.Turtle() # set the turtle shape to 'turtle' t.shape('turtle') # move the turtle forward t.forward(100) # stamp a copy of the turtle shape onto the screen t.stamp() # move the turtle forward again t.forward(100) # stamp another copy of the turtle shape onto the screen t.stamp() # exit the turtle screen turtle.done() ``` In this code, the `turtle` module is imported and a turtle object named `t` is created. The `shape()` method is used to set the turtle shape to 'turtle'. Then, the turtle is moved forward using the `forward()` method and a copy of the turtle shape is stamped onto the screen using the `stamp()` method. This process is repeated again to stamp another copy of the turtle shape onto the screen. Finally, the turtle screen is exited using the `turtle.done()` method. ### 回答2： Python中的Turtle模块是一个功能强大的绘图工具，可以用来制作各种图形和动画。其中，stamp()是Turtle模块中的一个方法，用于在绘图窗口上复制当前海龟位置的图案。 使用stamp()方法非常简单，只需在创建了一只海龟对象后，调用该方法即可。例如： import turtle # 创建一个海龟对象 my_turtle = turtle.Turtle() # 移动海龟到指定位置 my_turtle.goto(100, 100) # 复制当前位置的图案 my_turtle.stamp() 以上代码创建了一个海龟对象my_turtle，并将该海龟移动到坐标(100, 100)的位置。接着，我们调用了stamp()方法，将当前位置的图案复制到绘图窗口上。 使用stamp()方法可以创建一些有趣的效果。例如，我们可以利用循环语句来连续复制一系列的图案，从而绘制出一条线。下面是一个示例代码： import turtle # 创建一个海龟对象 my_turtle = turtle.Turtle() # 循环复制图案，绘制出一条线 for i in range(10): my_turtle.forward(50) my_turtle.stamp() my_turtle.right(90) # 程序运行结束后，不关闭绘图窗口 turtle.done() 以上代码创建了一个海龟对象my_turtle，并使用循环语句复制了一系列的图案。每复制一次图案，海龟向前移动50个单位，并顺时针旋转90度。运行程序后，我们可以在绘图窗口上看到一条由重复图案组成的线。 总而言之，Python中的Turtle模块是非常有趣和强大的绘图工具，而stamp()方法则可以在绘图窗口上复制当前海龟位置的图案，使得绘图更加灵活多样。 ### 回答3： Python中的turtle模块是一个强大的图形库，用于绘制图形和动画。turtle.stamp()是其中的一个函数，用于在当前位置绘制一个形状，并在画布上留下一个印记。 turtle.stamp()函数可以在绘图结束后进行调用，它的作用是将当前的海龟图标在画布上复制并留下一个印记。这样做的好处是可以在不改变海龟当前状态的情况下，将图标复制到不同的位置。 具体使用方法为： 1. 首先导入turtle模块：import turtle 2. 创建一个画布：turtle.Screen() 3. 创建一个海龟对象：turtle.Turtle() 4. 移动海龟到需要留下印记的位置：turtle.goto(x, y) 5. 调用stamp()函数：turtle.stamp() 其中，x和y表示的是需要留下印记的位置的横纵坐标。例如，可以使用turtle.goto(100, 100)将海龟移动到坐标为（100, 100）的位置，并在这个位置留下一个印记。 通过多次调用turtle.stamp()函数，可以在不同的位置留下多个印记。这样就可以在画布上绘制出多个重复的图标。 总的来说，turtle.stamp()是turtle模块中的一个函数，用于在当前位置绘制一个形状，并在画布上留下一个印记。它可以通过调用turtle.goto()函数移动海龟到不同的位置，并在这些位置留下多个印记，从而实现多个重复图标的绘制。

“相关推荐”对你有帮助么？

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 2
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值