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介绍
structToolbox 是一个广泛使用的工具箱,专门用于代谢组学和其他组学数据的分析。它提供了一系列的数据预处理、统计分析和机器学习方法,特别强调统计和机器学习的重要性。这个工具箱允许用户构建广泛且标准化的数据分析工作流程。structToolbox 中的方法和工具是通过由 struct 包提供的基于类的模板实现的,包括预处理方法(例如信号漂移和批次校正、标准化、缺失值插补和缩放)、单变量(例如 t 检验、各种形式的方差分析、Kruskal-Wallis 检验等)和多变量统计方法(例如 PCA 和 PLS,包括交叉验证和置换检验)以及机器学习方法(例如支持向量机)。STATistics Ontology (STATO) 已经被整合并实施,以为不同的方法、输入和输出提供标准化定义。
structToolbox 能够处理代谢组数据的原因在于它提供了一套完整的数据分析流程,从数据的预处理到最终的统计分析和结果解释。这些方法不仅适用于代谢组学数据,还适用于其他组学数据的分析。通过这些工具,研究人员可以更有效地识别和解释生物样本中的模式和变化,从而推动生物学研究的深入发展。