Trimmomatic是一个灵活的用来处理Illumina二代测序数据中的reads工具。
由于在写该博文的时候Trimmomatic的官网无法打开,且使用源代码安装失败,所以这里介绍如何利用conda 来安装Trimmomatic。
1. 进入conda环境
新建或者进入已有的conda环境。我这里进入的是conda base 环境。
2. 安装Trimmomatic
终端输入如下命令来安装Trimmomatic,中途输入y,确认安装依赖的其它程序包。
conda install -c bioconda trimmomatic
参考:
【1】bioconda/packages/trimmomatic 0.39链接:https://anaconda.org/bioconda/trimmomatic
作者:贾思特
日期:2023-4-28