Seurat 提供了一个内置的数据集,名为 “pbmc_small”,用于演示和测试。以下是一个例子,展示了如何使用这个数据集来创建一个 DimPlot 图。
首先,你需要加载 Seurat 库和数据集:
library(Seurat)
data("pbmc_small")
然后,你需要对数据进行一些预处理,包括归一化,识别高方差基因,进行主成分分析(PCA),并找出聚类:
pbmc_small <- NormalizeData(pbmc_small)
pbmc_small <- FindVariableFeatures(pbmc_small, selection.method = "