2024年7月,凌恩生物助力客户发表文章60+篇,累计影响因子341.3分,其中包括One Earth、Chemical Engineering Journal、Nano Today、Water Research、Journal of Hazardous Materials、Environment International等期刊文章。此次收录的文章涵盖多个研究方向,其中多组学研究28篇,微生物方向25篇,基因组方向14篇,转录组方向9篇,代谢组方向8篇,宏病毒组方向4篇,数据库构建方向1篇,云平台方向2篇。
接下来小编挑选了一些高分文章,让我们一起回顾一下吧~
第1篇
微生物组的高度多样性限制了全球植物根瘤菌群中病原体的流行
英文题目:High microbiome diversity constricts the prevalence of human and animal pathogens in the plant rhizosphere worldwide
发表期刊:One Earth
影响因子:15.1
作者单位:南京农业大学
涉及的凌恩生物服务产品:二代16S扩增子
主要研究内容:
农业土壤作为人类和动物致病菌的来源常常被忽视,且人们对推动土壤中病原体在全球分布的因素仍然知之甚少。本研究汇总了 342 对土壤和根际土壤微生物组数据,鉴定到9516 种潜在的致病扩增子序列变体(ASV),其中75%是人畜病原体。与土壤本体相比,根际的病原体具有较高的相对丰度和多样性,且根际中有11种关键物种已被报告为人类肠道病原体。发现增加微生物多样性可以降低病原体的流行率。这项研究通过为重新设计粮食生产系统提供方向,将可持续粮食生产和公共卫生利益进行关联。
第2篇
生物清洗与物理清洗一体化技术对AnMBRs生物污垢控制及节能减排的意义
英文题目:Significance of integrated therapy of biological and physical cleaning for biofouling control and energy saving in AnMBRs
发表期刊:Chemical Engineering Journal
影响因子:13.3
作者单位:北京师范大学
涉及的凌恩生物服务产品:二代16S扩增子+云平台
主要研究内容:
为了避免单一生物污染控制方法的局限性,本研究提出了群体猝灭 (QQ) 和物理清洗(即反冲洗和气体喷射)的协同处理方法,以经济高效地控制厌氧膜生物反应器 (AnMBR) 的膜生物污染。QQ降低了悬浮物质胞外聚合物 (EPS) 中的蛋白质含量,并抑制了上清液中有机胶体的含量,进而导致膜生物污染减轻。上清液中浮游生物的生物群落与滤饼层的生物群落相似,而悬浮物质的生物群落与滤饼层的生物群落有显著差异,表明上清液中的浮游生物对AnMBR中膜生物污染形成有重要意义,而QQ可以通过降低上清液中浮游生物的含量来减少AnMBR中膜生物污染。结果表明,通过QQ、气体喷射和反冲洗的协同处理可以显著提高AnMBR 中的生物污垢控制成本效益。
第3篇
通过天然的“矛和盾”植入物涂层调整微生物生态系统:设计细菌细胞外囊泡用于感染治疗
英文题目:Adjusting the microbial ecosystem via a natural “spear and shield” implant coating: Engineering bacterial extracellular vesicles for infection treatment
发表期刊:Nano Today
影响因子:13.2
作者单位:四川大学
涉及的凌恩生物服务产品:真核有参转录组
主要研究内容:
微生态失衡引起的细菌感染性疾病对人类健康构成了严重威胁,而传统的抑菌策略往往存在不够精准、细菌易产生耐药性等局限性。本研究利用金黄色葡萄球菌的细菌胞外囊泡(EVs)构建了由聚单宁酸(pTA)介导的稳定植入物涂层。所得到的EVs涂层功能类似于“矛和盾”,具有自主区分非亲本细菌(N-细菌)和亲本细菌(P-细菌)的能力,使植入物在体外和体内具有兼具精确性和选择性的调节能力。在该构建体中,革兰氏阳性菌的EVs涂层改变了细菌的代谢和膜转运。TA介导的EVs涂层为推进传染病的微生态控制研究以及与微生态失衡相关的其他疾病的治疗提供了研究基础。
第4篇
基于宏基因组学的流域尺度抗性基因组多生境分布及融合
英文题目:Multi-habitat distribution and coalescence of resistomes at the watershed scale based on metagenomics
发表期刊:Journal of Hazardous Materials
影响因子:12.2
作者单位:陕西省环境科学研究院
涉及的凌恩生物服务产品:抗性宏基因组
主要研究内容:
河流中抗性基因组的分布特征已有广泛研究,但抗性基因组在多种生境中的分布模式以及上游生境对水体抗性基因组谱的贡献尚不清楚。本研究探讨了石川河流域四种生境(水体、沉积物、生物膜和河岸土)中抗生素抗性基因(ARG)、金属抗性基因(MRG)和可移动基因元件(MGE)的分布和结合情况。研究结果显示,四种生境和两个季节的抗性基因组丰度和多样性存在显著差异。夏季抗性基因组的组装过程以随机过程为主,冬季以确定性过程为主。研究阐明了河流系统中耐药性的多生境分布模式和迁移机制,为有效监测和控制细菌耐药性提供了新的见解。
第5篇
新型水解酶 IpcH 启动新分离菌株 Rhodococcus sp. D-6 中异丙威的降解
英文题目:The novel hydrolase IpcH initiates the degradation of isoprocarb in a newly isolated strain Rhodococcus sp. D-6
发表期刊:Journal of Hazardous Materials
影响因子:12.2
作者单位:南京农业大学
涉及的凌恩生物服务产品:细菌扫描图
主要研究内容:
异丙威 (IPC) 是一种代表性的单环氨基甲酸酯类杀虫剂,具有环境污染风险和对非靶标生物的危害,但其降解机制尚未见报道。本研究从红球菌属中分离得到一株新的IPC降解菌株D-6,并分析了其IPC降解特性和途径。鉴定出一种新的水解酶IpcH,可以将IPC水解为2-异丙基苯酚。此外,IpcH 对各种类型的氨基甲酸酯杀虫剂表现出催化活性,包括单环氨基甲酸酯、双环氨基甲酸酯和线性氨基甲酸酯。菌株 D-6 可通过其降解能力有效降低 IPC 和 IPP 对敏感生物的毒性。本研究对IPC降解途径和IPC降解的分子机制进行了初步报道,为生物修复IPC和IPP污染环境提供了良好的潜在菌株。
第6篇
厌氧电子穿梭体对Shewanella oneidensis MR-1在水中厌氧单硝基苯酚还原的影响
英文题目:Distinct influence of model electron shuttles on anaerobic mononitrophenols reduction in aquatic environments by Shewanella oneidensis MR-1
发表期刊:Journal of Hazardous Materials
影响因子:12.2
作者单位:安徽大学
涉及的凌恩生物服务产品:转录组+qRT-PCR
主要研究内容:
单硝基酚 (mono-NPs) 是最简单的硝基酚 (NPs),常见于水生环境中,容易受到厌氧生物还原和共存电子穿梭 (ESs) 的影响,但对其潜在的机制缺乏了解。本文阐明了 Shewanella oneidensis MR-1 厌氧单 NPs 生物还原的途径,并评估了模型 ES 对这些过程的影响。研究发现在厌氧条件下,S. oneidensis MR-1 可以将所有三种单 NPs 异构体轻易还原为相应的氨基酚。并且外源添加醌类物质会通过与关键外膜蛋白相互作用加速单NPs生物还原。同时发现添加核黄素不会影响所有三种单 NPs 异构体的生物还原。这项研究加深了我们对单 NPs 的环境命运及其生物转化过程的理解,为受硝基苯酚污染场地的生物修复提供了宝贵的见解。
第7篇
关于氮回收:微藻和细菌的共培养提高了富氮蓝藻素的产量
英文题目:Toward nitrogen recovery: Co-cultivation of microalgae and bacteria enhances the production of high-value nitrogen-rich cyanophycin
发表期刊:Water Research
影响因子:11.4
作者单位:湘潭大学环境与资源学院
涉及的凌恩生物服务产品:二代16S、18S扩增子+宏基因组binning+宏转录组+氨基酸靶向代谢
主要研究内容:
藻菌废水处理工艺已被证明能高效去除养分并回收氮(N)。然而,对有价值的富氮生物聚合物蓝藻素的回收技术仍然有限。本研究探讨了两个藻菌共生反应器中蓝藻素的合成机理和回收潜力。结果表明,藻类和细菌之间的协同作用增强了氮和磷的去除。藻菌联合体中蓝藻素的粗含量与传统活性污泥相比显著增加。通过宏基因组分析发现蓝藻素生产者在藻菌系统中很常见。研究还确定了两种蓝藻素的细胞内合成途径,发现一些丰度较高的MAG能够将硝酸盐和铵同化为蓝藻素,表现出较强的氮利用能力。首次在废水微生物群落中发现了蓝藻素合酶编码基因(cphA)的潜在水平转移。该研究为高价值富氮生物聚合物蓝藻素的回收利用提供了新的思路,有助于提高废水资源化利用水平。
第8篇
营养负荷驱动的细菌和微真核生物群落的滞后和非同步状态转变
英文题目:Hysteretic and asynchronous regime shifts of bacterial and micro-eukaryotic communities driven by nutrient loading
发表期刊:Water Research
影响因子:11.4
作者单位:河海大学
涉及的凌恩生物服务产品:二代16S、18S扩增子
主要研究内容:
营养污染在许多城市河流中普遍存在,而减少营养物质输入但未能改善生物群落的恢复措施往往缺乏效用,因为生物体,尤其是多种生物体,在增强生态系统稳定性和功能方面具有不可或缺的作用。研究多分类群落对城市河流营养物负荷的响应模式对于生物群落结构的恢复以及生态系统功能的恢复具有重要意义。本研究结果表明,细菌和微真核生物群落都存在双稳态,表明微生物群对营养物负荷的响应具有滞后性。潜在分析表明,高营养负荷降低了后生动物的相对丰度,但增加了真核藻类的相对丰度,加剧生态系统功能的退化。此外,微生物群落的恢复可能还有利于氮循环功能的改善。
第9篇
中药添加剂对高密度饲养武定鸡抗生素耐药性风险的比较:利与弊
英文题目:Comparison of Chinese medicine additives for antibiotic resistance risks in the Wuding chickens under high stocking density: Advantages and drawbacks
发表期刊:Journal of Cleaner Production
影响因子:9.7
作者单位:云南农业大学
涉及的凌恩生物服务产品:宏基因组
主要研究内容:
具有抗病特性的传统中药已越来越多地用于畜牧业作为抗生素的替代品。然而,当引入中药时,抗生素耐药基因 (ARG) 在畜牧业中的流动性、细菌宿主和潜在人类危害仍然存在不确定性。本研究收集了不同饲养密度并用不同中药处理的武定鸡的盲肠食糜进行宏基因组的分析。鉴定出的ARG 亚型多为多药耐药和氨基糖苷类耐药基因。同时发现了一些致病性抗生素耐药菌(PARB)。且高饲养密度并未观察到ARGs的传播,这可能是由于抗生素的使用受到限制。此外,与饲喂其他中药的高饲养密度鸡相比,饲喂盐酸小檗碱的高饲养密度鸡中观察到更高比例的可移动遗传元素和一些多药耐药PARB,促进了ARGs的水平基因转移并对人类健康构成潜在的风险。
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