Clustal Omega
这是生信中经典的序列比对软件/代码,许多模型都使用了它,比如Tranception+Retrieval
报错信息:
Could not find argtable2.h
C compiler cannot create executables
核心问题是安装时,发现它需要argtable2,从源码make install argtable2后通过CFLAGS赋予argtable2/include路径时,报C编译器错误,网上基本都是说gcc版本问题,但尝试均无果,借此记录下解决过程与方法。
非root用户./configure
./configure --prefix=your_path
缺少argtable2.h
yum search argtable
yum install -y argtable.x86_64 argtable-devel.x86_64
安装流程
1.安装argtable2,建议使用上述命令安装
也可以去官网下载源码make && make install(记得加系统路径)
2. ./configure --prefix=your_path
3. make && make install
#Clustal Omega源代码地址:http://www.clustal.org/omega/#Documentation