(一)量子化学计算如何选择硬件配置
由于分子的类型、体系和模拟算法,以及各种应用和精度要求,都有不同的计算特点,对计算机硬件(CPU、内存、硬盘、GPU)配置要求有很大的差异 ,那么如何选择好服务器/工作站的硬件配置,提高计算速度,缩短求解时间?主要看用量子化学计算软件的算法,及做什么求解,因为算法和精度决定了计算特点和求解规模,合理的硬件配置,大大发挥机器性能,缩短求解时间。
主要量子化学软件:Gaussian,GAMESS,MOLPRO,NWChem
1.1量子化学算法、精度与计算成本
1.2原子体系规模、算法及硬件配置特点
NO |
体系规模划分 |
主要算法 |
硬件配置最低推荐 |
1 |
1000个原子以上 |
分子力学 |
多GPU架构 |
2 |
250-1000个原子 |
半经验或DFTB |
4核~16核+32~64GB内存 |
3 |
100-250个原子 |
密度泛函DFT |
4核~44以上+64~128GB |
4 |
25-100个原子 |
多体微扰理论方法MPn |
8核~64核+128~256GB+高io
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5 |
10-25个原子 |
耦合簇CCSD(T) |
8~64核+192GB+高io |
6 |
10个原子以下 |
组态相互作用法CI/CC |
8~96核以上+256GB+高io
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1.3以Gaussian为例&#