bwa mem 比对发生解析amb文件错误 Parse error reading ref.fa.amb.

bwa mem 比对发生解析amb文件错误 Parse error reading ref.fa.amb.

这个问题我在外网上找到了答案👇,
https://www.biostars.org/p/228886/(原网址)
在这里插入图片描述

其实是一个很小的问题,或许你的fasta文件里存在着空格、空行,总之,any space
用python的strip()函数处理一下(文件小也可以手动删除),再重新bwa index 再bwa mem就可以运行下去了。

这告诉我们,出现了问题在论坛上找不到答案,还可以百度啊,百度很强👍

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