KEGG 通路信息下载及其相关处理

1. KEGG数据下载
   打开kegg官网：
   http://www.genome.jp/kegg/catalog/org_list.html
   
   然后点击相应物种前面三个字母缩写位置进入下载界面：
   
   然后点击相应的格式进行下载，我们最常用的下载格式是htext
   下载到.keg 格式的文件
   我下载的是人的全部的KEGG文件，其文件名称为hsa00001.keg

2. 文件探索
   2.1 初步看看各种通路信息

grep '^C' hsa00001.keg | tail

2.2 看看共有多少通路信息

 grep '^C' hsa00001.keg | grep "hsa" | wc
 #     370    2205   19727 

3. 文件解析
   3.1 第一种解析

awk '$1=="C" &&$NF~"PATH:" || $1=="D"' hsa00001.keg | grep -P "PATH|\tK