批量将DICOM文件转换为NIfTI文件使用ITK

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本文详细介绍了如何利用ITK库在Python中批量将DICOM医学图像文件转换为NIfTI格式。首先,需要安装ITK库,接着导入所需的Python库,指定输入和输出文件夹,然后通过ITK读取DICOM文件并转换成NIfTI。最后,提供了一个批量转换的函数,将所有DICOM文件转换为相同名称的NIfTI文件,方便在不同医学图像处理软件中使用。
摘要由CSDN通过智能技术生成

DICOM(数字图像和通信医学)是医学图像的标准格式,而NIfTI(神经影像信息技术倡议)是另一种常用的医学图像格式。在某些情况下,我们可能需要将DICOM文件转换为NIfTI格式,以便在不同的医学图像处理和分析软件中使用。本文将介绍如何使用ITK(医学图像处理工具包)来批量转换DICOM文件为NIfTI格式。

ITK是一个功能强大的开源软件库,用于处理和分析医学图像。它提供了丰富的功能,包括DICOM和NIfTI文件的读取和写入。下面是使用ITK进行批量转换的步骤:

步骤1:安装ITK库
首先,我们需要安装ITK库。可以通过以下命令使用pip安装ITK:

pip install itk

步骤2:导入必要的库
在开始转换之前,我们需要导入一些必要的Python库。除了ITK之外,我们还将使用os库来处理文件和文件夹,以及glob库来查找DICOM文件。

import os
import glob
import itk

步骤3:指定输入和输出文件夹
我们需要指定包含DICOM文件的输入文件夹和将保存NIfTI文件的输出文件夹的路径。确保输入文件夹中只包含DICOM文件。

input_folder = 
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