生物信息学分析在临床前研究中的应用

生物信息学分析在临床前研究中的应用

临床前研究简介
临床前研究是指药物进入临床研究之前所进行的化学合成或天然产物提纯研究,药物分析研究,包括药效学、药动学和毒理学研究以及药剂学的研究以及对细胞和动物潜在治疗干预措施的药物评估。然后,根据药物在疾病模型中的有效性和安全性来选择参加临床试验的候选人。在临床试验开始之前,所有药物都需要来自各种毒理学临床前研究的数据,以支持其对人体的潜在安全性。

生物信息学分析在临床前研究中的应用
随着基因组的发展,基因组学方法经常用于药物开发的目标识别/验证阶段,但在临床前阶段经常忽略基因组学的方法。在药物进入临床之前,有必要在体内和体外进行功效和安全性测试,此过程既费时又昂贵。而且,获得的功效和安全性评估数据的结果并不代表所有个体。如通过基因组分析,我们可以研究导致体内药物代谢差异以及不同基因型对药物反应不同的相关基因。从而加速了药物作用和安全性的评估。总之,通过基因组学方法,微阵列技术或下一代测序技术,再结合生物信息学方法,可以有效地识别与毒理学或非靶向作用有关的基因组变化,给后续湿实验提供数据基础,在很多大程度上为临床前研究节约时间,人力和物力成本。

具体应用

  1. 基因分型分析:通过对微阵列数据或者各组学测序数据进行基因分型分析,挖掘与药物反应的个体差异有关的遗传多态性,包括:通过与药物代谢酶相关的基因多态性分析,预测药物反应中个体差异的原因;分析药物转运蛋白的基因多态性,以预测影响药物转运,吸收,分布和消除体内差异的原因;对药物靶标的基因多态性的分析可以预测个体中不同药物作用(例如不同剂量)的原因。
  2. 数据挖掘:与相关的药物数据库相结合,可以预测药物的功效,预测药物的剂量,避免药物的ADR并找到药物的新靶标。

药效学试验流程
药效学试验流程

相关文献举例

  1. Hasan MN, et al. Assessment of Drugs Toxicity and Associated Biomarker Genes Using Hierarchical Clustering[J]. Medicina (Kaunas). 2019 Aug 8;55(8):451.
  2. Kaye JB, et al. Warfarin Pharmacogenomics in Diverse Populations[J]. Pharmacotherapy. 2017 Sep;37(9):1150-1163.
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