生物信息学在生物医药领域的应用

简介

生物信息学是生命科学,信息学,数学,计算机,化学,物理等多学科相互交融而形成的一门学科,生物信息学的应用几乎覆盖了生物医学研究的各个领域。生物信息学对于现代生物学和医学数据的分析具有重大意义,其研究成果将对人类社会和经济产生巨大推动作用。通过用生物信息学的方法,对基因组学,转录组学,蛋白质组学,微生物组学,表观遗传学,代谢组学,免疫组学等各种不同的组学数据进行分析,对疾病机制机理研究,相关基因的发现,药物靶点分析,药物发现,以及疾病的个性化治疗提供了新的见解与解决方案。

不同组学数据分析在生物医药医学研究中的应用

转录组:转录组(transcriptome)是指特定生物体在某种状态下所有基因转录产物的总和,转录组研究是功能基因组研究的一项重要内容。RNA-seq技术能够在单核昔酸水平对特定物种的整体转录活动进行检测,从而全面快速地获得该物种在某一状态下的几乎所有转录本信息。

基因组:基因组是指一个生物体的一套染色体中的完整的DNA序列。通过生物信息学的方法对基因组信息进行挖掘对于鉴定遗传性疾病、表征驱动癌症进展的突变和追踪疾病爆发极为重要。

蛋白质组:蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组进行比较分析,可以得到不同蛋白质在不同样本中的表达情况,找到差异表达蛋白,进而对差异表达的蛋白进行功能注释分析。

代谢组:通过对代谢组学数据进行分析,可以对生物体内的小分子代谢物进行定性定量分析,找出代谢产物变化与生物体生理生化变化的相对关系。挖掘疾病发生过程中生物体内代谢物的变化信息,以及药物作用后引起的生物体代谢变化,从而获得有关疾病发病机制,药物代谢作用和药理毒理方面的信息。

表观遗传学:表观遗传学是一种调控基因表达的可逆途径,通过DNA和组蛋白的化学修饰,决定特定基因是否能得以表达。表观遗传学调控多种生命活动及疾病发生发展,已成为近年来生命科学领域的研究热点,促使了生物学多领域研究的突破性进展。

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