肿瘤(Oncology)生物信息学分析简介
肿瘤简介
肿瘤是临床上患者死亡最常见的原因,是发生在机体某个系统多个器官、某个器官多个系统,或者这两种情况共同存在的一种复杂的疾病。肿瘤分为良性肿瘤和恶性肿瘤。而其中的恶性肿瘤,就是常说的癌症。癌症是由于一些遗传改变和表观遗传改变而导致的疾病,在它最简单的形式中,癌症是一种由于一个细胞基因组变化而导致的遗传性疾病。这种遗传改变包括点突变、插入突变、缺失突变和染色体易位等。这些基因的变化可以导致细胞和组织生长异常,这就是肿瘤的表型特征。
生物信息学在肿瘤研究中的应用
肿瘤是一种由 DNA 变异不断累积而导致细胞发生不受控激增并形成新生物的疾病。随着测序技术的发展以及后基因组时代的到来,分子生物学家能够更加精细地研究肿瘤DNA(基因组)、mRNA(转录组)和蛋白序列(蛋白质组)。通过生物信息学分析,主要目标是结合各个组学的分析,鉴定新的原癌基因或者抑癌基因来为肿瘤诊断、肿瘤临床结果预测和肿瘤靶标治疗提供新的方法。比如,肿瘤细胞有各种 DNA 突变,通过生物信息分析找出哪些基因在肿瘤形成与发展的早期有关键作用也是件重要的研究工作。在这些基因中找到突变会是未来癌症诊断并找出治疗方法中最关键的步骤。最终为肿瘤个性化治疗提供数据数据支持。
研究领域:
- 联合多组学(如基因组,转录组,蛋白组,代谢组)对疾病的发生机理机制进行研究。
- SNP基因型分析和DNA序列分析用于检测与疾病或药物反应相关的新SNP。
- 生物标志物鉴定:用于测量药物功效和作用机理的生物标志物鉴定。
- 预测生物标记物:以对患者对药物的反应进行分类/分层。
- 靶标识别和确认。