SNP检测实验技术介绍

SNP检测实验技术介绍

一、技术概述

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)是基因组中单个碱基的变异,在人类基因组中广泛存在,与疾病易感性、药物反应及个体化医疗等密切相关。通过特异性探针或深度测序精准识别SNP位点,提供基因分型、等位基因频率及功能预测分析,助力遗传机制研究与临床转化应用。

二、实验目的

通过检测样本中目标SNP位点的基因型(如AA、AG、GG),分析其与表型(疾病、药物疗效、性状等)的关联性,为疾病研究、个体化用药等领域提供数据支持。  

三、实验流程
1、DNA抽提

取200ul全血至1.5mL离心管中,严格按照“TIANamp Genomic DNA Kit”试剂盒说明书步骤进行提取。  

2、PCR扩增

1)将Mix在4℃下融解,轻柔地上下颠倒混匀并进行短暂离心。

2)冰上配制下表中的反应液

成分

加入量

终浓度

PrimeSTAR Max Premix(2X)

15μL

Forward Primer (10μM)

0.6μL

0.2 μM

Reverse Primer (10μM)

0.6μL

0.2 μM

DNA

100 ng

RNase-free Water

To30μL

3)将反应管进行短暂离心,确保所有反应液在反应孔底部。

4)采用三步法程序进行反应:

循环数

步骤

温度

时间

40

预变性

98℃

10s

变性

55℃

5s

退火

72℃

5s

  1. 定量测序
  • 技术优势

✅ 高通量:单次实验可分析数百至数万样本

✅ 支持单个位点检测(TaqMan)或大规模筛查(测序芯片)  

✅ 广泛兼容:适用于低浓度DNA样本。

  • 适用范围

1️⃣ 临床诊断

2️⃣ 药物基因组学

3️⃣ 农业育种

4️⃣ 肿瘤研究

六、代表性实验结果

 

           

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