SNP检测实验技术介绍
一、技术概述
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)是基因组中单个碱基的变异,在人类基因组中广泛存在,与疾病易感性、药物反应及个体化医疗等密切相关。通过特异性探针或深度测序精准识别SNP位点,提供基因分型、等位基因频率及功能预测分析,助力遗传机制研究与临床转化应用。
二、实验目的
通过检测样本中目标SNP位点的基因型(如AA、AG、GG),分析其与表型(疾病、药物疗效、性状等)的关联性,为疾病研究、个体化用药等领域提供数据支持。
三、实验流程
1、DNA抽提
取200ul全血至1.5mL离心管中,严格按照“TIANamp Genomic DNA Kit”试剂盒说明书步骤进行提取。
2、PCR扩增
1)将Mix在4℃下融解,轻柔地上下颠倒混匀并进行短暂离心。
2)冰上配制下表中的反应液
成分 | 加入量 | 终浓度 |
PrimeSTAR Max Premix(2X) | 15μL | 1× |
Forward Primer (10μM) | 0.6μL | 0.2 μM |
Reverse Primer (10μM) | 0.6μL | 0.2 μM |
DNA | 100 ng | |
RNase-free Water | To30μL |
3)将反应管进行短暂离心,确保所有反应液在反应孔底部。
4)采用三步法程序进行反应:
循环数 | 步骤 | 温度 | 时间 |
40 | 预变性 | 98℃ | 10s |
变性 | 55℃ | 5s | |
退火 | 72℃ | 5s |
- 定量测序
- 技术优势
✅ 高通量:单次实验可分析数百至数万样本
✅ 支持单个位点检测(TaqMan)或大规模筛查(测序芯片)
✅ 广泛兼容:适用于低浓度DNA样本。
- 适用范围
1️⃣ 临床诊断
2️⃣ 药物基因组学
3️⃣ 农业育种
4️⃣ 肿瘤研究
六、代表性实验结果