单细胞测序技术及应用进展

单细胞测序技术及应用进展

作者：朱忠旭 陈新 

发表于： 基因组学与应用生物学，2015 年，第34 卷，第5 期，第902-908 页

 

本文讲了什么？

细胞是生命的单位，然而大多数的人类基因组、癌症或其它研究仍然是通过从多个细胞中抽提DNA 来进行测序，这忽略了细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为的影响，实验结果往往表示的是细胞群体中信号表达的均值，或者只代表其中在数量上占优势的细胞信息，单个细胞独有的细胞特性往往被忽略。

 

解决方法

单细胞测序技术：

1.单细胞分离技术 （梯度稀释法、显微操作技术、荧光激活细胞分选、微流控技术、激光捕获显微切割）：将目的细胞的从样本中分离出。

2.单细胞全基因组扩增技术（基于热循环以PCR 为基础的全基因组扩增技术）：将单个细胞溶解得到微量基因组DNA进行高效地扩增，获得高覆盖度的单细胞

3.单细胞转录组扩增技术

 

目前单细胞技术存在问题

单细胞测序技术已经在肿瘤、发育生物学、神经科学、微生物等领域取得了丰富的成果。但目前该技术还存在一些问题；例如扩增存在偏倚性，非特异性扩增，建库过程中存在污染，检测灵敏度不高，技术噪音高，操作失误率高，重复性差、除mRNA 以外的非编码RNA 难以检测等。

且目前很少有专门针对单细胞测序数据分析的软件和工具。