labelme标注医学图像之后批量把json文件转化PNG

1、把json都放在同一目录下

这里写个py即可

#!/usr/bin/env python
# coding : utf-8

import os
import shutil

absolute_path = os.path.dirname(__file__) #获取本文件的绝对路径
absolute_path = absolute_path[:-len('/scripts')]
all_file_name = os.listdir(os.path.join(absolute_path,'image_dataset'))
json_file = [] #存储json文件名字
for i in all_file_name:
    if i[-4:] == 'json':
        json_file.append(i)
print(json_file)
for i in json_file:
    shutil.copy(os.path.join(absolute_path+'/image_dataset',i),os.path.join(absolute_path,'image_dataset_label'))

自己根据自己的路径做一些修改。

2、编写一个shell脚本

shell脚本的作用是利用labelme_json_to_dataset这个程序（它是anaconda创建labelme环境时自带的，所以后面需要在anaconda的labelme环境下执行shell）

#!/bin/bash
echo "Now begin to search json file..."
for file in ./*
do
    if [ "${file##*.}"x = "json"x ]
    then
    filename=`basename $file`
    temp_filename=`basename $file  .json`
    suf=_json
    new_filename=${temp_filename}${suf}
#    echo $new_filename
    cmd="labelme_json_to_dataset ${filename} -o ${new_filename}"
    eval $cmd
    fi
#    printf "no!\n "
done

这里参考了here。
自己根据自己的路径做一些修改。

3、打开anaconda环境

在win下搜索anaconda Prompt,进入之后是这样

4、在labelme环境下执行shell

即输入 json2png.sh即可。

写在最后：以上基于安装好anaconda,并且创建了一个叫做labelme的环境，在这个环境下安装了labelme，如果环境名称不叫labelme，自行在命令中替换即可。