第一步:获取基因的位置信息
tool : ensembl biomart
url : website of biomart
获取的信息需要包括基因名,起始,终止,染色体,正负链,注意:此处的正负链需要转为bedtools可以识别的- +
第二步:获取你感兴趣的基因位置
R merge即可
第三步:使用bedtools 获取fasta file of genes you are interested
第四步:blast
先做记录,后续编为一个脚本实现
第一步:获取基因的位置信息
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url : website of biomart
获取的信息需要包括基因名,起始,终止,染色体,正负链,注意:此处的正负链需要转为bedtools可以识别的- +
第二步:获取你感兴趣的基因位置
R merge即可
第三步:使用bedtools 获取fasta file of genes you are interested
第四步:blast
先做记录,后续编为一个脚本实现