龙共宝于木水-CSDN博客

原创 10生物化学与分子生物学——酶促反应动力学

当底物浓度很大时，Vmax=K3 [E] 成线性关系，而直线的斜率为K3，为一级反应速率常数，它表示当酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子转换底物的分子数，此常数又叫做转换数（简称TN），又称为催化常数（catalytic constant，Kcat）。在K3远小于K1、K2时，Km看作Ks，也只有此时1/Km才可以近似表示酶与底物结合的难易程度（1/Km越大，酶与底物越容易结合，催化的反应越快，即Km越大，酶与底物结合越不容易）有机汞、有机砷化合物：与酶蛋白上的-SH作用，从而抑制含-SH酶的活性。

2024-06-01 10:14:29 1055 1

原创 9生物化学与分子生物学——酶通论

rRNA基因的转录产物即rRNA前体（大约6400个核苷酸残基）很不稳定，在鸟苷和Mg2+存在下切除自身的内含子（intron或intervening sequence，IVS-居间序列或间插序列），使两个外显子（exon）拼接起来，形成成熟的rRNA，此过程没有任何蛋白酶参与，称为自我剪接（self-splicing），并证明RNA具有催化活性。其大小可以反映酶的催化效率。能一部分解释酶的专一性，但酶促反应是一个可逆的过程，酶的底物和酶催化反应的产物结构已经不一样了，此学说对酶促反应的逆反应无法解释。

2024-05-24 16:42:58 912 1

原创 8生物化学与分子生物学——蛋白质的分离、纯化和表征

SDS能断裂分子内和分子间氢键，破坏蛋白质的二级和三级结构，强还原剂能使半胱氨酸之间的二硫键断裂，蛋白质在一定浓度的含有强还原剂的SDS溶液中，与SDS分子按比例结合，形成带负电荷的SDS-蛋白质复合物，这种复合物由于结合大量的SDS，使蛋白质丧失了原有的电荷状态形成仅保持原有分子大小为特征的负离子团块，从而降低或消除了各种蛋白质分子之间天然的电荷差异，由于SDS与蛋白质的结合是按重量成比例的，因此在进行电泳时，蛋白质分子的迁移速度取决于分子大小。样品流速和滤膜方向平行，而透过滤液的流速和滤膜方向垂直。

2024-04-16 09:15:51 2062

原创 7生物化学与分子生物学——蛋白质结构和功能的关系

但是原本血红蛋白表面由苯丙氨酸和赖氨酸这两个疏水氨基酸可以形成一个口袋状的结构（结合氧的情况下，口袋并不形成，但脱氧就会形成），这个口袋中心部位的氨基酸正常人是谷氨酸，谷氨酸带电荷，口袋是疏水的，所以不结合，而突变成缬氨酸之后，疏水基团之间一结合，造成血红蛋白多聚体的形成，使得血红蛋白在溶液中溶解度大幅度降低，结晶析出，刺破细胞。Fe2+移动时，拖动HisF8残基，并进而引起螺旋F合拐弯EF和FG的位移，这些移动传递到亚基的界面，引发构象的重调，导致四级结构的改变（T→R，利于和氧气结合）

2024-04-10 09:33:33 1652 1

原创 6生物化学与分子生物学——蛋白质的三维结构

α-螺旋是蛋白质的一条多肽链或者多肽链的一个部分以假想的一个主轴为中心，以右手螺旋的方式形成的螺旋，此螺旋每隔3.6个氨基酸残基，就上升一圈，一圈的高度是0.54nm，形成螺旋的所有氨基酸残基的侧链基团都伸向这个螺旋的外侧。异亮氨酸：侧链的分支很大，就不容易形成α-螺旋；以横坐标为Φ的角度，纵坐标为ψ的角度，得到图画中不同颜色标注的部分，颜色最深的部分就认为是空间结构稳定的一种构象，颜色稍微淡一点的被认为可以形成这样的二面角（不稳定），通过此图可以确定多肽链中所有二面角的可能性，进而得到它的稳定空间结构。

2024-04-02 16:04:08 2942 3

原创 5生物化学与分子生物学——蛋白质的共价结构

蛋白质换算系数最早是由Mulder 在1839年提出的，他把几种蛋白质高度纯化处理后，发现它们都有一个共同的分子式 C40H62N10O12,通过这个分子式，可以计算出其中的氮占蛋白质分子的16%，因此，氮到蛋白质的换算比例为6.25。从理论上讲，肽链形成的肽键都是单键，但实际上，由于形成肽键中的酰胺上有一个孤电子对，此孤电子对离域后于羰基碳的轨道之间有重叠，通过此重叠，氮和羰基碳的氧之间形成了共振相互作用，最终在肽键间形成了共振杂化体的结构。纤维状蛋白外形呈纤维状或细棒状，分子是有规则的线性结构。

2024-04-01 14:15:29 927

原创 4生物化学与分子生物学——氨基酸

将某种氨基酸放入盐酸的溶液中，使其全部质子化（这样，一氨基一羧基AA即可称为二元酸，二氨基一羧基或者二羧基一氨基等可称为三元酸）然后再逐步地加羟基（碱），使其逐渐开始解离，首先是羧基上地氢开始解离，然后是氨基上的氢再解离在某一状况下，溶液中的氨基酸既带正电荷又带负电荷，称其为兼性离子当此溶液中静电荷为0时，氨基酸不带电，称此pH为氨基酸的等电点pI（isolectric point）碱水解：Trp稳定；自然界中组成蛋白质的氨基酸都是L型，生物体内的糖一般是D型），Arg（精氨酸）脱氨。

2024-04-01 10:20:12 1003

原创 3生物化学与分子生物学——脂类

油脂的化学本质是酰基甘油（acylglycerol），其中主要是三酰甘油（triacylglycerol,TG）或称甘油三酯（triglyceride），此外还有少量的二酰甘油（DG）、单酰甘油（MG）（这两者之所以会存在是因为它们是代谢中间产物）前列腺素：最初是从前列腺的分泌液中提取而得到，实际上后来发现在人体的所有组织器官中都有它的存在，种类较多，不同的前列腺素或同一前列腺素作用于不同的细胞，产生不同的生理效应，如升高体温，促进炎症，控制跨膜转运，调整突触传递，诱导睡眠，扩张血管等。

2024-03-30 16:07:30 1599 1

原创 2生物化学与分子生物学——糖类

四肽的单位，跟乙酸的羧基所连接的第一个氨基酸是L型的丙氨酸，然后是一个D型的谷氨酸，然后是一个L型的赖氨酸，最后是一个D型的丙氨酸中间两个氨基酸是通过谷氨酸的γ羧基和赖氨酸的α氨基缩合，比较特殊（一般肽键形成是每个氨基酸的α氨基、羧基之间缩合）相比于直链淀粉是α-1，4糖苷键进行连接，纤维素是通过β-1，4糖苷键进行连接直链淀粉一般是呈左手螺旋的形式存在，而纤维素一般是以充分延展的方式，多个多糖结构聚集，靠侧链之间的氢键和疏水非共价键排列紧密。纤维素是自然界中最丰富的有机物，主要作为植物的结构多糖。

2024-03-29 18:31:58 926

原创 1生物化学与分子生物学笔记——绪论

全部生物分子归根结底都是由环境中获得的小分子前体如O2、H2O、NH3和N2组成的，经过一系列代谢反应生成：丙酮酸、苹果酸、柠檬酸和3-磷酸甘油等中间代谢物，并转变为各种构件分子如：氨基酸、单糖、核苷酸、脂肪酸、甘油和胆碱等。Berg 的第一个基因工程菌的完成；糖类、脂类、核酸、蛋白质、代谢物：氨基酸、糖、有机酸、核苷酸；第三类元素：Fe、Cu、Co、Mn、Zn。第四类元素：包括Al、As、B、Br、Mo、I、F、Ni等，某些生物必须。第二类元素：S、P、Cl、Ca、K、Na和Mg，组成生命体的基本元素。

2024-03-29 17:53:38 411 1

gyjugg12的博客