单细胞测序原理10X UMI Barcode

什么是单细胞测序

单细胞RNA-Seq提供成千上万个单个细胞的 transcriptional profiling。这种水平的通量分析使研究人员能够在单细胞水平上了解哪些基因表达，多少数量以及异质样品中成千上万个细胞之间的差异。

目前，测序可以回答以下6类问题：

DNA的序列：ATCG怎么排列，以及各序列的丰度；

DNA的表观遗传修饰：比如甲基化、羟甲基化，以及组蛋白的各种修饰；

RNA的序列：AUCG怎么排列，以及各序列的丰度；

RNA的表观遗传修饰：比如近年很火的m6A修饰；

染色质的结构：3C、4C、5C等各种C；

其他魔性应用：比如DNA损伤位置、蛋白-蛋白相互作用等。

单细胞测序，就是想办法在单细胞层面去回答以上6类问题。

为什么非用单细胞测序不可？
世界上没有两片相同的叶子。对于多细胞生物来说，细胞与细胞之间是有差异的。当然了，这个差异可大可小。
比如说，受精卵从一个细胞开始分裂，并逐渐形成囊胚，最终发育成个体的时候，细胞与细胞之间的差异会越来越大：有的分化成神经元，有的分化成骨骼肌，各自表达着不同的遗传信息，承担着不同的生理功能。
又比如在肿瘤组织中，肿块中心的细胞，肿块周围的细胞，淋巴转移灶的细胞，以及远端转移的细胞，其基因组和转录组等遗传信息，是存在差异的。而这种差异，在临床上，可以决定该肿瘤对某种疗法是否有效。