1.下载/安装Aspera
下载地址:http://downloads.asperasoft.com/en/downloads/8?list
选择对应的版本,我用的是centos7_x64服务器,安装文件aspera-connect-3.7.2.141527-linux-64.sh
使用普通用户进行安装
sh aspera-connect-3.7.2.141527-linux-64.sh
把aspera-license复制到系统目录
sudo cp ~/.aspera/connect/etc/aspera-license /usr/local/bin/
2.下载sra数据
~/.aspera/connect/bin/ascp -k 1 -QT -l 100M -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -T anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByExp/sra/ERX/ERX069/ERX069505/ERR091571 .
-i后面是秘钥文件,如果是直接操作服务器终端秘钥文件为:asperaweb_id_dsa.putty,若是ssh登陆则是上面的秘钥。把对应的ftp地址换成上面的格式即可,后面的.表示下载保存路径,这里为当前目录
(ps:ncbi更新了ftp目录,可以根据后缀ID查找ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/ERR/ERR091/ERR091571/)
注意事项
Q1:
Q
1
:
若使用ssh登录服务器,运行命令后提示你要输入密码,把秘钥文件改成asperaweb_id_dsa.openssh
Q2: Q 2 :
Session Stop (Error: Server aborted session: Client requests stronger encryption than server allows)
添加 参数-T可以解决该问题
ascp -T file transfer_user@host:/
Q3:
Q
3
:
aspera默认不支持断点续传,要支持这个功能添加参数
ascp -k 1
参考:
https://www.plob.org/article/3013.html
https://support.asperasoft.com/hc/en-us/articles/216126788-Error-Client-requests-stronger-encryption-than-server-allows
https://support.asperasoft.com/hc/en-us/articles/216125578-Resuming-file-transfers-with-ascp
https://www.plob.org/article/7338.html 获取ftp下载地址