Rendering color of SWC in Vaa3D

最新推荐文章于 2024-03-04 15:29:12 发布
最新推荐文章于 2024-03-04 15:29:12 发布
阅读量220 收藏
点赞数
分类专栏： V3D Vaa3d 文章标签： Vaa3D V3D
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/jujiyu6446/article/details/105567078
版权
Vaa3d 同时被 2 个专栏收录
43 篇文章 12 订阅
订阅专栏
V3D
20 篇文章 0 订阅
订阅专栏

SWC is a widely used file format of neuronal structure. In SWC format, the neuronal structure is described as a series of nodes. Each node has properties including index, location, type, radius, at most one parent.

Vaa3D is an open-source visualization and analysis software. https://github.com/Vaa3D

The rendering color is determined by the type of each node in Vaa3D.

The color rule can be seen in the source file:

v3d_external\v3d_main\3drenderer\renderer_obj.cpp
0白色
1黑色
2红色
3蓝色
6黄色
7绿色
20-275用于matlab热力图

在这里插入图片描述

远野贵树97
关注
  • 0
    点赞
  • 踩
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
专栏目录
Unity3D - 颜色空间 （Color Space）
biezhihua的专栏
08-06 2万+
除了选择渲染路径(Rendering Path)之外，在使用照明之前选择“颜色空间(Color Space)”也很重要。
解读论文《A Hierarchical 3D Gaussian Representation for Real-Time Rendering of Very Large Datasets》
最新发布
Deep_coding_Q的博客
05-19 1575
解读3DGS作者最新论文：SIGGRAPH'2024，解决超大场景渲染问题。
Unity3D change standard shader rendering mode in runtime
yaoyutian的博客
05-18 1827
https://docs.unity3d.com/Manual/MaterialsAccessingViaScript.html "Instead, Unity tracks which variants you’ve used by examining the material assets used in your project. Whichever variants of the Sta
unity3d渲染路径Rendering Path
TxNet
11-22 3797
Unity支持不同的渲染路径。应具体取决于你的游戏内容和目标平台/硬件来选择使用哪一个。不同的渲染路径有不同的特点和性能特点，主要影响灯光和阴影。        项目所使用的渲染路径在Player Settings选择。此外，可以为每个摄像机重写（不同摄像机可以是不同的设置）。如果图形卡不能处理选定的渲染路径，Unity将自动使用一个较低保真度的设置。因此，在GPU上不能处理延迟照明（Defer
Color Temperature & Color Rendering Index DeMystified
wolf96的专栏
04-21 2262
http://lowel.tiffen.com/edu/color_temperature_and_rendering_demystified.html "What is color? No object of itself alone has color. We know that even the most brightly colored obje
3D Gaussian Splatting是什么以及为什么这么火
热门推荐
lovely_yoshino的博客
03-04 1万+
其实和MVS，SFM，Nerf这类比较类似，但是我们发现辐射场一类场景表示方法已经在新视角渲染任务上得到了革命性的进展，但是在高分辨率图片上由于需要使用神经网络，导致训练和渲染都需要十分昂贵的代价，因此最近那些速度比较快的方法都不可避免地需要通过损失质量来提高速度。而3D 高斯泼溅（Splatting）是用于实时辐射场渲染的 3D 高斯分布描述的一种光栅化技术，它允许实时渲染从小图像样本中学习到的逼真场景。
Open3d报错X Error of failed request: GLXBadFBConfig
biter0088的博客
10-30 4774
open3d报错： X Error of failed request: GLXBadFBConfig Major opcode of failed request: 151 (GLX) Minor opcode of failed request: 34 () Serial number of failed request: 33 Current serial number in output stream: 31
Thinking in Unity3D：渲染管线中的Rendering Path
15 年专注游戏引擎与游戏开发，分享实用方案、经验与干货教程！
03-25 6380
Thinking in Unity3D：渲染管线中的Rendering Path 关于《Thinking in Unity3D》 笔者在研究和使用Unity3D的过程中，获得了一些Unity3D方面的信息，同时也感叹Unity3D设计之精妙。不得不说，笔者最近几年的引擎研发工作中，早已习惯性的从Unity3D中寻找解决方案。 Un...
【Unity3D日常开发】Unity3D的Color Space（颜色空间）【全解析】
CSDN博客专家，Unity3D高级软件工程师，《Unity 3D从入门到实战》作者。
10-19 2492
先放一张图感受一下：在Unity打包选项中，有一个Color Space的选项，有Gamma和Linear两个选项。主要作用是设置Unity是否对输入的默认贴图进行转换处理，法线贴图不存在这个问题。Gamma时，Unity不会在后台将图片进行转换，输入的即使是经过矫正的图片，Unity也不会处理，比如Remove Gamma Correction去除伽马校正Gamma Correction伽马校正都不会发生，除非自己手动实现。Linear时，Unity就会进行统一线性空间的流程，也就是。
Vaa3D与Qt简要介绍（入门教程）
远野贵树的博客
05-17 2877
教程1：编译Vaa3D 分为在windows、mac、ubuntu等系统上编译。 原始教程 https://github.com/Vaa3D/Vaa3D_Wiki/wiki/Build-Vaa3D-on-Linux https://github.com/Vaa3D/Vaa3D_Wiki/wiki/Build-Vaa3D-on-Windows-(VS2010-and-QMake) 编译时一些问题的教...
Vaa3D 神经元可视化辅助分析软件界面基本介绍
远野贵树的博客
07-08 2378
一、打开图片 启动Vaa3D神经元可视化辅助分析软件； 通过File—Open-Image（快捷键Ctrl + O）读取三维神经元图片。 二、主界面操作 图片打开后进入截面三视图主界面； 主界面左上角为截面三视图，各个截面可通过鼠标滚轮更改聚焦位置； 主界面右侧为Options区域，主要功能有Focus Coordinates（聚焦点）、Zoom（缩放）、Channels（通道）、Landm...
Vaa3D__无法打开包括文件:“tiffio.h”
远野贵树的博客
06-20 2159
..\..\..\..\v3d_external\v3d_main\basic_c_fun\stackutil.h(64) : fatal error C1083: 无法打开包括文件:“tiffio.h”: No such file or directory 一般容易在新建工程时出现该问题，在pro文件中如下路径即可 …\v3d_external\v3d_main\common_lib\incl...
Matlab_按顺序读取多个tif文件后转化为三维图像栈
远野贵树的博客
10-09 1404
多个JPG文件或者tif文件都行 close all clear suffix='.tif'; imgFolder='D:\dateset\DIADEM\Olfactory Projection Fibers\Image Stacks\OP_9\'; SaveName=[imgFolder 'final.tif']; if ~exist(imgFolder,'dir') error('im...
vaa3d_神经元追踪算法介绍之SWC模型_neuron tracing
远野贵树的博客
08-29 1252
swc文件中，一般在前几行加注释等信息，注释以“#”开头。 swc可以认为是一系列点的组合，每一行就是一个点。 ##n,type,x,y,z,radius,parent n 当前点编号 type 类型、颜...
Vaa3d中神经元重建结果颜色对照图
远野贵树的博客
12-27 1110
Vaa3d中神经元重建结果颜色由SWC文件中的type列控制 0 白色 1 黑色 2 红色 3 蓝色 6 黄色 7 绿色 超过20 ...
Vaa3D并行程序测试-OPENMP-VS2010-加速程序
远野贵树的博客
05-28 1088
首先，我能确定的是该OPENMP测试程序通过Qt自带的MINGW编译器直接编译有效，但是我没有对VS编译器进行测试，究竟有没有提升，提升了多少我没有进行测试，因为普通的垃圾代码会被VS优化。 首先是pro文件 QMAKE_CXXFLAGS+=/openmp QMAKE_CFLAGS += /fopenmp 有的地方说只插入第一个行即可，但是保险起见，两个都写上。 测试C文件 值得注意的是需要加上#include <omp.h> 在需要多线程的for循环前，加上#pragma omp paral
Vaa3D_MATLAB计算SD、SSD
远野贵树的博客
11-05 1083
在追踪结束以后，常需要计算追踪结果的SD和SSD，通过这三个文件可以实现SD、SSD的计算，通过与批量插件运行相结合可以直接得到结果，然后该结果可以在matlab中进行下一步的处理，如写入到excel文件中等。 同理，在CalculateMetric.m文件中可以再加入其他的测量指标，如DIADEM metric等。 CalculateMetric.m 函数 function [MetricO...
matlab批量转化nrrd图像为tif___Vaa3D
远野贵树的博客
05-20 1004
在v3d中也支持nrrd图像的处理，但是windows 系统下不支持打开？不知道是不是我的v3d版本的问题。 因此写了一个nrrd图像批量转化为tif文件的代码，不过运行效率比较低。主要分为三个文件 nrrdread.m nrrdread.m 这个是从网上下的，这个文件里面，我去掉了Endian属性，因为我处理的图像是8位的，没有这个属性可选。 function [X, meta] = nrrdr...
SDFDiff: Differentiable Rendering of Signed Distance Fields for 3D Shape Optimization
07-25
C知道: 对于3D形状优化，SDFDiff是一种可微分渲染方法，用于处理有符号距离场（Signed Distance Fields）的优化问题。SDFDiff的目标是通过对SDF进行优化，来改善三维形状的外观和性能。 传统的SDF优化方法通常使用离散化网格表示，并通过离散化的方式对形状进行调整。然而，这种方法在处理复杂形状时存在一些限制，并且无法提供光滑的形状变化。 SDFDiff通过将SDF视为函数，并利用函数的可微性质，使其能够直接应用于渲染过程中。具体而言，它使用了渲染方程和光线追踪技术来计算SDF的梯度，并利用这些梯度进行形状优化。 SDFDiff的优点是可以处理复杂形状，并且能够提供光滑的形状变化。它还可以与其他优化算法结合使用，例如梯度下降或优化器，以进一步改善形状。 总而言之，SDFDiff是一种针对3D形状优化的可微分渲染方法，通过对SDF进行优化来改善形状的外观和性能。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值