关于RNA-seq 的那点事Count 数的标准化 (一) RPKM 和FPKM,TPM及C(R)PM
图片来自网络我们都知道,在RNA seq 测序的过程中,我们测完序的最终目的是想根据测序的结果,最终分析得到差异基因以及潜在可能的功能分析,那么在进行差异分析以及对表达量进行分析的时候,对基因原始的Count 进行标准化,消除由于测序过程中单个基因自身的长度以及测序深度对数据的影响,是非常关键的一步。RNAseq 测序,对于一个基因的Count 的计数呢,主要是基于匹配到该基因的外显子上的数目,那么按照这样理解的话,基因越长,比对到该基因(外显子)上的count 数就越多;而影响Count 的...
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2021-01-10 17:52:38 ·
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