关于单细胞批次矫正那些事(二) KBET 用于单细胞批次矫正结果的评估
之前我们根据GB 那篇文章了解到了对于常见的用于单细胞批次矫正分析的常见的方法Harmony LIGER以及Seurat3 等,那么文章也推荐如果是批次矫正后用于下游的分析的话推荐ComBat,MNN以及ZINB-WaVE以及scMerge这几种方法,但是其实这几种方法获得的批次效应处理和细胞类型聚类效果还不是很好。A test metric for assessing single-cell RNA-seq batch correction 评估单细胞测序批次矫正的一个指标今天我们进一步的分析再批
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2021-03-11 21:52:42 ·
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