R语言 生物信息必备技能 最为准确而全面的基因ID转化方法

第一种办法：基于网页工具
 

bioDBnet - Biological Database Network

db2db模块可以非常方便地实现各种ID之间的转换，当然 bioDBnet的功能有很多，可以试试。

第二种办法：基于org.Hs.eg.db包

library(AnnotationDbi)
library(org.Hs.eg.db)
library(tidyverse)

如果你有基因

gene <- c("SDC1","CXCL2","CYR61","PSMD2","GRB2","CMTM1","CTSE","VEGFC","CBL")

想知道其对应的ENTREZ ID 或者 ENSEMBL ID

Symbol到ENSEMBL之 ：select

select(org.Hs.eg.db, #.db是这个芯片数据对应的注释包
                      keys=gene,
                      columns=c("SYMBOL&#