基因间的相互作用纷繁复杂,同一个基因在不同信号通路和功能本体中也可能发挥不同的功能,于是就需要做一些分类。现在我们做测序基本上都躲不开的路就是,差异基因富集性分析,把松散零碎的基因聚集起来,再来一套GO分析和KEGG分析的组合拳。
GO,全称Gene Ontology(基因本体),GO分析分为三个部分:细胞组分(cellular component, CC)、分子功能(molecular function, MF)、生物过程(biological process, BP)。通过GO数据库我们就可以找到这个基因在这三个层面的归类,和哪些功能及过程相关。
通常我们可以直接去GO数据库查找,但是比较繁琐,今天给大家介绍的这位新朋友GAIL不但能分析Gene-GO之间的关系,还可以分析基因间的互作关系,十分好用。