LncRNADisease database数据库使用方法

LncRNADisese database

数据库概览

 

进入LncRNADisease database主页（见文末），该数据库收录来自实验结果支持的lncRNA与disease关联数据，以及蛋白、mRNA、miRNA和DNA等不同分子类型与lncRNA相互作用研究结果，包括结合、调控和共表达关系，所有数据均可供浏览或下载。

 

当前版本总共集成近3000个lncRNA分子与disease关联数据条目，475个lncRNA交互条目。除外信息查询功能，该数据库还可以基于一个新的lncRNA基因组背景来预测其可能的相关疾病，建立新的lncRNA与disease关联性，目前提供1564个人类lncRNAs对疾病的预测结果。

 

 

主页History提供既往数据库更新信息，目前最新版本为2019年1月份更新的LncRNADisease 2.0版本，在Links处点击链接进入，2.0版新增实验结果支持的circRNA与疾病关联数据，提供ncRNA、mRNA和miRNA之间调控关系数据，并为每个lncRNA与疾病关联条目提供置信评分。

 

该版本目前涵盖19166个LncRNAs和823个circRNAs与529种疾病之间，总计205959个LncRNA-disease关联条目和1004个circRNA-disease关联条目以及2297个LncRNA和198个circRNA病因学条目，物种包括人、大鼠、小鼠和鸡等。

 

 

点击Browse，预览该数据库收录的lncRNA信息和疾病信息：左侧栏lncRNA条目下任选一个点击进入，第一个表格提供该lncRNA详细信息，包括名称，染色体位置，基因组起止位点，DNA链，别名，Genbank链接，以及Gene序列和RNA序列信息。

 

文章剩余内容<<<<