在单细胞数据分析过程中，上游的拆库定量，中游的分群注释，目前的门槛是很低的了。但是解析细胞类型异质性不应止于这些，还可以看细胞群之间的通讯。当然，这方面我们介绍过CellChat：细胞间相互作用分析利器。CellChat是以信号通路为单位来计算细胞间交流状态的，很多同学用cellphonedb来做基于配受体对的细胞间交流。今天，我们就来用经典的pbmc3k数据跑一下cellphonedb，并尝试可视化。
先放一张想象图：
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