基因在细胞系当中的表达数据库，CCLE使用简述

    相信大家都听说过CCLE（Cancer Cell Line Encyclopedia）。简单来说，这个数据库做了很多细胞系当中基因表达、突变、拷贝数以及DNA甲基化的结果。利用这个数据库我们可以了解一个细胞系当中某一个基因的基本情况。那么这么丰富的数据要如何使用呢？下面我们简单介绍一下。

根据官网链接进入主页面，如下图所示：输入基因名或者细胞系名后检索即可。

 

这里我们以基因YTHDF1为例，输入后提交。

可以看到YTHDF1的相关信息简介及通往其他外部gene数据库的链接。

其中可以看到共包括5个菜单栏，下面我们就每个菜单栏的功能进行简要介绍。

 

1.     Distribution by Lineage

该模块数据按照细胞系分布。

默认选项打开后可得到如下结果：显示给定数据集的基因表达数据的分布。箱形图通过不同细胞系中基因表达的平均分布进行分类和着色。高表达分布在左侧，并用红色显示。

 

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