CCLE数据库,全称“Cancer Cell Line Encyclopedia”,可以看做是【癌症细胞系的百科全书】CCLE(Cancer Cell Line Encyclopedia),是由Broad Institute 研究所牵头的一项肿瘤基因组学研究项目,涵盖了三十多种组织来源上千种细胞系基因表达情况、突变、拷贝数、甲基化等,是研究肿瘤的利器。
CCLE数据数据可视化和分析可通过DepMap portal实现。
Depmap癌症依赖图,系统地识别基因和药物依赖性以及预测它们的生物标记。
搜索某一基因 https://depmap.org/portal/gene/BRAF?tab=overview&characterization=expression
下载数据集 https://depmap.org/portal/download/