TCGA免疫浸润评价数据库，TIMER 2.0 使用指南

对于RNA-seq的数据，之前我们的分析方法只是局限于单个基因之间的整合分析，最多也就是做一下富集这样的聚类分析。前段时间随着肿瘤免疫的热度，也有人试着开始利用RNA-seq这样的数据来评价患者的免疫情况。

 

基本的过程也就是我们提供RNA-seq的数据。然后使用相对应的算法来评估每个样本的免疫浸润程度。51xxziyuan.com

 

 

目前关于免疫浸润的评估就有 TIMER, CIBERSORT, quanTIseq, xCell, MCP-counter等一些的算法，这些很多都是需要自己下载代码来进行分析的。但是TIMER算法的作者，最近把TCGA所有癌症的RNA-seq的基于不同算法的结果都进行了运算，同时也把结果放到了网站上，这样我们就可以查各个算法当中具体的免疫情况。今天我们就来介绍一个TIMER 2.0这个数据库。

 

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