SurvivalMeth数据。广泛研究表明,DNA甲基化相关功能元件(DMFE),如CpG岛相关元件(CIR)、转录相关元件(TR)、重复元件(RE)及细胞类型特异性CTCF结合区(CTCFBR)和超级增强子(SE)等,可作为肿瘤患者生存预后的潜在标志物。SurvivalMeth数据库收集来自TCGA、CCLE和GEO等数据库中36个肿瘤的13371个样本中81个DNA甲基化图谱数据,涵盖19000个编码基因、1689653个超级增强子、1304902个CTCFBR和77634个重复元件,总计超过480000个DNA甲基化位点信息,构建比例风险回归模型,提供感兴趣基因及甲基化相关功能元件的预后分析功能,用户可以进行自定基因或甲基化功能元件组合,借助SurvivalMeth数据库完成预后相关DMFEs的全面分析,包括DMFE甲基化水平、相关分析、临床分析、差异分析、DMFE注释及生存分析与可视化等。
肿瘤相关甲基化预后分析数据库SurvivalMeth详细使用指南
最新推荐文章于 2024-01-19 10:22:04 发布