SPM FDR校正

最新推荐文章于 2025-02-15 21:27:04 发布

lingllllove

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文章标签：人工智能

本文链接：https://blog.csdn.net/lingllllove/article/details/135092754

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本文介绍了SPM8中的两种FDR校正方法，包括voxel-wise FDR和topological FDR。针对voxel-wise FDR，需修改spm_defaults文件中的相关设置，将topoFDR设为0。在SPM中选择FDR校验即可。对于topological FDR，需要设置extent threshold为FDRc对应的值。SPM中的peak-level FDR基于FDRp，可以用于高度阈值或范围阈值的设定。文章还简要解释了topological FDR的原理，强调了其在处理fMRI数据中的优势，并引用了相关文献。

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SPM8允许两种FDR校验。一个是voxel-wise FDR，另一个是topological FDR。

如果要做voxel-wise FDR 校验，就把spm_defaults里的68行的defaults.stats.topoFDR 改为0。（有很多朋友下载下来的spm在处理结果是只显示FWE矫正和NOR,但是FWE矫正又太严格，我们往往需要FDR矫正来进行数据处理。spm的设置是在spm根目录下的spm_defaults这个文件。需要再matlab中调用才能编辑。在matlab中输入edit spm_defaults，在68行有defaults.stats.topoFDR = 1; 你把1改成0即可。当然你也可以对默认阈值、默认设置的激活体素大小进行设置。）此时SPM8里的FDR按钮会出现。在SPM里点results，选FDR校验即可。如果要做topological FDR 校验，就把defaults.stats.topoFDR设为1（默认是1）。首先在SPM8里点results——None（无校验）——T threshold或p value（自己随意设，默认的0.001也可以）——extent threshold（默认0即可）。然后在左下侧窗口点whole brain会得到results table。找到FDRc对应的值。然后再次点Results——None——T threshold或p value（输入上一次的值，例如上一次是0.001，这一次还是0.001）——extent threshold（输入FDRc对应的值）。这样得到的激活图就是cluster-wise FDR校验的结果，也就是topological FDR校验的结果。