SPM FDR校正

SPM8允许两种FDR校验。一个是voxel-wise FDR,另一个是topological FDR。

如果要做voxel-wise FDR 校验,就把spm_defaults里的68行的defaults.stats.topoFDR 改为0。(有很多朋友下载下来的spm在处理结果是只显示FWE矫正和NOR,但是FWE矫正又太严格,我们往往需要FDR矫正来进行数据处理。spm的设置是在spm根目录下的spm_defaults这个文件。需要再matlab中调用才能编辑。在matlab中输入edit spm_defaults,在68行有defaults.stats.topoFDR = 1;  你把1改成0即可。当然你也可以对默认阈值、默认设置的激活体素大小进行设置。)此时SPM8里的FDR按钮会出现。在SPM里点results,选FDR校验即可。如果要做topological FDR 校验,就把defaults.stats.topoFDR设为1(默认是1)。首先在SPM8里点results——None(无校验)——T threshold或p value(自己随意设,默认的0.001也可以)——extent threshold(默认0即可)。然后在左下侧窗口点whole brain会得到results table。找到FDRc对应的值。然后再次点Results——None——T threshold或p value(输入上一次的值,例如上一次是0.001,这一次还是0.001)——extent threshold(输入FDRc对应的值)。这样得到的激活图就是cluster-wise FDR校验的结果,也就是topological FDR校验的结果。

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