mRNA比对原理（举例简述）

猛码先生

已于 2023-12-02 18:00:41 修改

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于 2023-12-02 15:57:43 首次发布

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1.比如mRNA的序列为

3-AAAGAGTGACGGAAAACAGACGGGTCAAAGTGGTCTTCATCCGGAGAAGGA-5

2.那么反转录后的cDNA应该是

5-TTTCTCACTGCCTTTTGTCTGCCCAGTTTCACCAGAAGTAGGCCTCTTCCT-3

（3-TCCTTCTCCGGATGAAGACCACTTTGACCCGTCTGTTTTCCGTCACTCTTT-5）

cDNA的双链为

3-AAAGAGTGACGGAAAACAGACGGGTCAAAGTGGTCTTCATCCGGAGAAGGA-5

5-TTTCTCACTGCCTTTTGTCTGCCCAGTTTCACCAGAAGTAGGCCTCTTCCT-3

3.上机从3端开始测序，也就是fastq序列为

5-AGGAAGAGGCCTACTTCTGGTGAAACTGGGCAGACAAAAGGCAGTGAGAAA-3

4.bam结果比对到的基因序列应该是

5-TTTCTCACTGCCTTTTGTCTGCCCAGTTTCACCAGAAGTAGGCCTCTTCCT-3

另一种情况

1.比如mRNA的序列为

3-ACGAGUAGAGGAACCGACA-5

2.那么反转录后的cDNA应该是

5-TGCTCATCTCCTTGGCTGT-3

（3-TGTCGGGTTCCTCTACTCGT-5）

cDNA的双链为

5-TGCTCATCTCCTTGGCTGT-3

3-ACGAGTAGAGGAACCGACA-5

3.上机从3端开始测序，也就是fastq序列为

3-TGCTCATCTCCTTGGCTGT-5

4.bam结果比对到的基因序列应该是

5-TGCTCATCTCCTTGGCTGT-3

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mRNA比对原理（举例简述）

3.上机从3端开始测序，也就是fastq序列为。4.bam结果比对到的基因序列应该是。2.那么反转录后的cDNA应该是。1.比如mRNA的序列为。
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