22. Lammps命令学习-7之read_restart

来源： “码农不会写诗”公众号
链接：Lammps命令学习-7之read_restart

read_restart file

  从restart文件中读取先前保存的系统配置从而可以继续先前的模拟。
  https://docs.lammps.org/read_restart.html

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Syntax

read_restart file

Description
从restart文件中读取先前保存的系统配置从而可以继续先前的模拟。

此操作会重新创建模拟盒，包括其中所有的原子及其属性，以及一些相关的全局设置，所有这些设置会跟前一次模拟写入restart文件时一样。

read_restart file

• file = name of binary restart file to read in

restart文件是二进制格式，可以使用lammps命令行-r2data参数将restart文件转换为data文件。
例如在以下情况都可以将其转化为data文件后使用：1. 在不同机器运行模拟，二进制文件可能无法通用时；2. 利用其他软件进行可视化或进行如原子筛选等后处理时。

lmp -h  # 查看lammps可执行文件帮助信息

通过以下命令之一可将restart文件(file.restart)转换为data文件(file.data)。

lmp -restart2data file.restart file.data
lmp -r2data file.restart file.data

以下是restart文件中已经存储的信息，即这些量在读取restart文件时，输入脚本中不需要重新指定。当然了，在读取restart文件后，可以重新定义这些设置中的许多项，比如将timestep重新设置为0等。

• units
• newton bond
• atom style and atom_modify settings id, map, sort
• comm style and comm_modify settings mode, cutoff, vel
• simulation box size and shape and boundary settings
• atom group definitions
• per-type atom settings such as mass
• per-atom attributes including their group assignments and molecular topology attributes (bonds, angles, etc)
• force field styles (pair, bond, angle, etc)
• force field coefficients (pair, bond, angle, etc) in some cases (see below)
• pair_modify settings, except the compute option
• special_bonds settings

以下是restart文件中未存储的信息，即在读取restart文件之后，必须在输入脚本中重新执行相关命令。

• newton pair
• fix commands
• compute commands
• variable commands
• neighbor list criteria including neigh_modify settings
• kspace_style and kspace_modify settings
• info for thermodynamic, dump, or restart output

简而言之，与系统配置相关的信息会存储在restart文件中，否则将需要重新定义或设置。

关于更细节的知识，本系列不会用到，姑且不细讲，以后有机会再共同探讨。

Example

read_restart save.10000
read_restart restart.*

Default
none

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书山有路勤为径，学海无涯苦作舟。今天就到这里啦，拜了个拜~

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