使用MG2C绘制基因染色体位置图

前记

MG2C（MapGene2Chrom）是由中国农业科学院烟草研究所烟草功能基因组创新团队开发的一款遗传图谱在线画图工具。这个工具旨在简化遗传图谱的绘制过程，使得科研人员无需编程基础也能轻松创建展示分子标记在染色体或基因组上相对位置的图谱。MG2C提供了一个用户友好的界面，用户只需根据提供的EXCEL数据模板准备相关信息，如基因位置、染色体长度等，然后将这些数据复制到MG2C的文本框中，点击“DRAW”按钮即可生成结果。此外，MG2C支持多种文件格式下载，包括JPG、PNG、TIFF和SVG等。

MG2C的开发是为了解决现有遗传图谱绘制工具（如MapChart、JoinMap等）通常需要用户具备一定的编程能力的问题，使得遗传图谱的绘制变得更加便捷和直观。该工具的研究成果已经发表在《分子园艺 (Molecular Horticulture)》上，对于基因功能定位、分析以及基因组大片段组装等领域的研究人员来说，MG2C是一个非常有用的资源。

网址导航如下：

MG2C_v2.1 (iask.in)http://mg2c.iask.in/mg2c%5Fv2.1/

一、数据的准备

MG2C只需要基因的物理位置信息和染色体长度信息即可进行绘制。

1、基因的位置信息

首列为基因ID，第二列和第三列为起始位置，第四列为染色体名称，其他列可以设置颜色。

2、染色体的长度信息

 主要为两列信息，第一列为染色体名称，第二列为染色体的长度。

二、绘制基因染色体位置图

将上述信息分别在MG2C中输入，如下所示：

点击DRAW，即可完成绘制，如下所示： 

可以进行下载，支持多种格式。

（推荐使用SVG格式，可利用AI进行个性化修改。）

 后记

很久没有用这个网站了，最近使用了一下，相对于其他工具，这个网站还是非常好用的。

针对于非生信人员，非常友好！

参考文献

[1] Jiangtao Chao#*, Zhiyuan Li#, Yuhe Sun, Oluwaseun Olayemi Aluko, Xinru Wu, Qian Wang* and Guanshan Liu*.(2021). MG2C: a user-friendly online tool for drawing genetic maps. Molecular Horticulture,1:16.
[2] Chao Jiangtao, Kong, Yingzhen, Wang Qian, Sun Yuhe, Gong Daping, Lv Jing, Liu Guanshan*. (2015). Mapgene2chrom, a tool to draw gene physical map based on perl and svg languages. Hereditas, 37(1):91-97.

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2024.3.28