脚本记录之snp-calling

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#!/bin/bash
#PBS -N transdecoder
#PBS -l nodes=zhangxclab002:ppn=12
#PBS -q batch
#PBS -V
#PBS -S /bin/bash
#RS144A.fa  RS150A.fa  RS247A.fa  RS255A.fa
#sample

myPATH="/home/chenss/kissplices"
#判断.fa文件并按顺序执行
dir=$(ls -l $myPATH |awk '!/^d/ {print $NF}' |grep -i ".fa" )
for i in $dir