每次遇到有人问怎么学生信时，总会碰到一个尴尬的问题，“有没有什么书可以推荐下”。骤然之下，也不知道该怎么回答。这个问题有点大，想不到一本书可以囊括。而且对提问人的基础和学习倾向没有了解，与其指条错路，还不如不指。最后我都会说，看生信宝典吧，有一系列由浅入深的Linux教程，R教程，Python教程和NGS教程；你要想学就按我写的做，有问题再讨论。
这个为生信学习打造的开源生信Python简明教程真香 | 视频5
视频 | 这个为生信学习打造的开源Linux/Bash教程真香！！！
视频连载12 - 这个为生信学习和生信作图打造的开源R教程真香！！！
后来想想，生信宝典虽然是凝练了很多书籍、经验的知识合体，但总会有涉及不到的地方和忽略了的地方。还是系统地整理下书籍，做为一个补充吧。
下面列出了关于 R、Python 和生物信息的经典书籍，大家按需选择，也欢迎留言推荐更多对你有帮助的书籍。
R速成: 统计分析和科研数据分析快速上手
《R速成:统计分析和科研数据分析快速上手》是挪威一位心理学教授和神经科学教授联手写成，第一次在国内推出中文版，由庄亮亮和赵子茜翻译，电子工业出版社于2023年4月出版。全书共 15 章，第 1 章详细介绍了 R 和 RStudio 的安装方法；第 2 章至第 3 章介绍了导入数据的方法，以及 R 的基本工作原理；第 4 章介绍了 R 中重要的数据 管理方法；第 5 章讲解数据可视化的知识；第 6 章至第 15 章介绍了统计知识点，如描述性统计、 简单线性回归、多元线性回归、虚拟变量回归等。（每天下午 15 点之前购买，当天发货；否则，第二天发货。可开发票，联系微信号: shengxinbaodian。）
或者与 R 实战连买！
R语言实战书第 3版（2023版）
这本书中文版第 1 版于 2012 年出版，距今已有 11 年，第 2 版于 2016 年出版，豆瓣评分 9.2，全系列累计销量已经突破 30 万册，是一本口碑与品质兼具的佳作。本书的原作者也一直关注着R 社区的变化，他针对读者反馈的新需求，对书中的内容进行了全新升级，力求能够跟上 R 的新变化。这本作为经典 R 书的延续，在 2023 年终于迎来了全新的第 3 版，书中内容不仅保留了前两版易于学习的章节设置，还增加了很多符合当下的新内容，尤其是新增了 tidyverse 系列包在数据管理和数据分析方面的各种功能，新增了使用 RStudio 进行编程、调试、编写报告和创建包的内容。
R数据科学
《R数据科学》的作者是Hadley Wickham，这个人我们大家一定很熟悉，ggplot2的开发者，Rstudio的首席科学家。当然他对R社区的贡献远不止于此，他的主页https://hadley.nz/有很多R的学习资料，如Advanced R。这本《R数据科学》原版也可直接在https://r4ds.had.co.nz免费阅读。
这本R数据科学从ggplot2绘图入手，降低了入门的难度和枯燥感。后面则顺着数据分析的主线，从数据读入、数据整理、格式转换、数据可视化到统计模型、Rmarkdown分享，是一本精心组织的涵盖R应用很多方面的一本经典之作。英文没问题的直接在线看英文版，喜欢质感的买本中文书抱着读读也是开卷有益。
Python编程：从入门到实践
Python已经成为我们实现梦想和改变世界的重要工具。掌握它，也许我们就能在这个充满挑战的时代迅速跃升。其实，不用再强调，大家已经充分意识到：学习Python刻不容缓。而练习强大的Python“魔法”需要配备一本“异常”靠谱的“魔法书”，好书无疑会让你的法力持续加持！
什么样的书能“异常”靠谱？能在豆瓣被读者打出 9.3分，能在Amazon 被读者打出4.7星评？能让全球近 300 万读者疯狂种草，甚至被赞为Python入门“圣经”？
就是这本常年霸占Amazon、京东等编程类图书榜榜首，影响力与销量堪比畅销小说的蟒蛇书——《Python编程：从入门到实践》！
流畅的Python
《流畅的Python》作者卢西亚诺·拉马略（Luciano Ramalho） 是Thoughtworks 首席咨询师、Python 软件基金会成员、巴西知名 Python 语言学习社区 Python Brasil 联合创始人。拥有 25 年 Python 编程经验，他的《流畅的Python》是编程领域经典作品，影响近 8 万读者，基于Python 3.10，内容详尽，精心设计的代码示例有近 500 段！还有大量的图和表，简直对学习真的太友好了！。
具体看ChatGPT的评价：
每日书籍推荐 - 生物信息学（第二版）
早期学习生信时，都会搜索到樊龙江老师的《生物信息学札记》，是入门的经典。后来这边札记整编成书《生物信息学》，广受欢迎。
近期，生物信息学第二版又正式在科学出版社出版了，囊括了更多的高通量数据分析的内容，包括转录组、宏基因组、3D基因组、DNA甲基化、单细胞组学、群体遗传分析等内容，可以作为很好的生信入门教材，对很多分析的基本概念、基本思路增加一些常识性的了解。
点击：http://www.ecsponline.com/preview.php?atc=1&goods_id=211487 获取完整目录和试读
《生物信息学实验指导》包括分子序列数据库、数据库序列搜索、多序列联配、系统发生树构建、序列拼接与基因预测、基因组可视化、蛋白质功能域及结构预测、非编码microRNA鉴定及其靶标预测、转录组分析、Python基础及利用Python提取序列共10个基础实验。这10个实验在个人电脑上即可完成，全部通过在线服务或Windows版软件来实现，操作方便，可加深初学者对理论知识的理解。
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