MCE | 打破 Western Blot 玄学操作

本文详细解析了Western Blot实验中可能出现的高背景、斑点及不理想条带等问题,并提供了相应的解决方案,包括优化洗涤步骤、选择合适封闭剂、调整抗体浓度、使用蛋白酶抑制剂等。此外,还强调了在检测磷酸化蛋白时的注意事项和选择合适抑制剂的重要性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

看我一顿操作猛如虎:

电泳 → 转膜 → 封闭 → 孵一抗 → 孵二抗 → 检测,剩下的就是等待。

图 1. Western blot 操作流程简介[1]

我的实验结果中出现了各种稀奇古怪的玩意儿???

■ 古怪一:高背景

 萌 Cece 分析:

1、洗涤不充分,膜没有洗干净。

2、封闭不充分,一抗可能直接结合到膜上,造成二抗孵育时在非特异性位点发生结合。

3、一抗/二抗浓度太高,出现非特异性结合。

 措施:

1、对于洗涤不充分,可适当增加洗涤次数和时间,也可尝试提高洗涤液中 Tween-20 的含量 (如提高至 0.5-1%) 。

2、要解决封闭不充分这个问题,可尝试延长封闭时间,也可更换封闭液。常用的封闭剂有 5% 脱脂奶粉、5% BSA、血清和明胶等,推荐室温封闭 1 小时以减少背景。另外,脱脂奶粉常含有酪蛋白,由于酪蛋白会结合磷酸化抗体而易产生高背景。因此,检测磷酸化蛋白时建议用 BSA 作为封闭剂。

3、如果一抗/二抗浓度太高,出现非特异性结合,洗涤也无法完全去除,建议设置多个抗体稀释梯度,从而筛选出合适的抗体比例。

古怪二:斑点

 萌 Cece 分析: 

封闭液中出现了不溶性物质。

 措施: 

建议将封闭液充分溶解后进行过滤。

怪三:最头疼的,没有按照预期结果出现令人满意的条带,如:加入 p38 抑制剂,但 p-p38 表达量没有变化。

 萌 Cece 分析:

p38 虽然在不同的细胞中广泛表达,但是在没有诱导的情况下,表达量很低。

 措施: 

为了成功检测到 p38 的表达,建议:

1、使用阳性对照确保实验体系没有问题。

2、根据实验设计与需求使用诱导物 (如 LPS) 提高表达量。

图 2. LPS 处理前后 p38 表达量对比[2]

SB202190 是一种选择性的 p38 MAPK 抑制剂。SB202190 与 p38 激酶的 ATP 袋结合。

图 3. 在 LPS 诱导的情况下, SB202190 抑制 p38 磷酸化水平[3]

SB203580 是一种 p38 MAPK 的选择性抑制剂。SB203580 抑制 p38 活性时,只抑制了由诱导剂 (如 LPS) 引起的 p-p38 增加量,但不改变 p-p38 的基础水平。这是由于 p38 的自身磷酸化,是不受 SB203580 影响的。

SB203580 通过降低下游 MAPKAPK2,HSP27 和 ATF2 磷酸化来调节 p38 MAPK 信号通路。SB203580 通过结合 ATP 结合区来抑制 p38 MAPK 的催化活性,但不能抑制上游激酶对 p38 MAPK 的磷酸化。

图 4. SB203580 作用机制[4]

So,找到了原因咱再来一次就离成功不远啦!阳光耀眼,乐观地,向前走!

除了以上建议外,萌 Cece 还有一些超实用法宝:

1、在裂解液中加入足量的蛋白酶抑制剂 (HY-K0011HY-K0010)。

2、检测磷酸化蛋白时,加入磷酸酶抑制剂 (HY-K0021HY-K0022HY-K0023)。

3、建议使用 RIPA 裂解液 (强) (HY-K1001)。

4、转膜结束后,使用丽春红染色确认转膜效果。

5、选用高灵敏度的 ECL 发光液, 特超敏 ECL 化学发光试剂盒 (HY-K1005)。

参考文献

1. Dae-Eun Jeong, et al. Western Blot Analysis of C. elegans Proteins. Methods Mol Biol. 2018; 1742: 213-225.

2. Weiju Wang, et al. Role of TLR4-p38 MAPK-Hsp27 signal pathway in LPS-induced pulmonary epithelial hyperpermeability. BMC Pulm Med. 2018 Nov 27; 18(1): 178. 

3. Yong Li, et al. Mogroside V inhibits LPS-induced COX-2 expression/ROS production and overexpression of HO-1 by blocking phosphorylation of AKT1 in RAW264.7 cells. Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai). 2019 Apr 1;51(4):365-374.

4. Gopinathan Pillai Sreekanth, et al. SB203580 Modulates p38 MAPK Signaling and Dengue Virus-Induced Liver Injury by Reducing MAPKAPK2, HSP27, and ATF2 Phosphorylation. PLoS One. 2016 Feb 22; 11(2): e0149486. 

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