complex heatmap基因表达量热图，差异表达分析热图

最新推荐文章于 2025-05-21 10:19:48 发布

cujiangcao2

最新推荐文章于 2025-05-21 10:19:48 发布

阅读量1.4k

点赞数

文章标签： r语言

本文链接：https://blog.csdn.net/cujiangcao2/article/details/126367638

版权

本文介绍如何使用R语言进行复杂heatmap的绘制，专注于基因表达量数据，包括从tpm文件处理到基因组信息整合，同时涵盖了差异表达分析，为研究提供可视化工具。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

col分类表头注释文件：head_group

表达量文件：tpm

基因组信息文件： genome

library(ComplexHeatmap)

iw=read.table('head',sep='\t',header = T)   ###col_ha,group信息
cs=iw[,1]
head(cs)


df<-read.table('gene_tpm1',sep='\t',header=F)
df[1:5,1:5]
#添加rownames的基因名
#iw=read.table('ttest_CV_LD.sort_non_top300.gene',sep = '\t')
rownames(df)=df[,1]

#iw=